在过去的三个月里,许多声音聚集在一起,表达了人类在抗击COVID-19的斗争中的团结。很明显,我们确实是在一起的。在全球科学界,研究人员和医疗工作者一直在分享数据和资源,以了解病毒是如何在人群中传播的,它是如何变化的,以及我们的免疫系统是如何做出反应的。
和大多数数据一样,基因组信息在标准化和共享后变得更加有价值。我很自豪地宣布我们已经发布了SARS-CoV-2数据工具包这样国际社会就可以精简和分享他们快速发展的抗击SARS-CoV-2疫情的工作。
的新工具包与许多Illumina的工作流程兼容,并使研究人员能够安全地直接从Illumina的全部测序器组合流数据到BaseSpace序列中心使用DRAGEN RNA病原体检测App进行快速、全面的分析。一旦分析完成,研究人员可以直接从BaseSpace Sequence Hub提交数据到公共数据库。
Illumina SARS-CoV-2 NGS数据工具包正在发布新的和更新的DRAGEN功能,利用DRAGEN的速度和准确性加快传染病监测和疫情应对。该工具包包括:
- 新的DRAGEN RNA病原体检测管道用于检测传染病,DRAGEN宏基因组学管道用于疫情监测
- SRA进口程序
- 全新GISAID分享App
SARS-CoV-2数据工具包使研究人员更容易快速检测和识别病毒序列,然后将他们的发现免费贡献给Illumina的基础空间序列枢纽的关键公共资源。与Illumina全套测序仪的直接集成将允许研究人员将分析的数据序列贡献给中央资源,从而实现更快速和彻底的疫情监测和其他流行病学分析。借助数据作为Illumina全球技术平台的通用语言,基因组研究人员在抗击COVID-19和未来疫情的过程中,现在可以以前所未有的方式共享信息。