如果我们想控制美国的COVID-19大流行，我们必须广泛提供SARS-CoV-2检测。如果不进行检测，公司、学校和公共卫生官员就会盲目行事，社区传播可能会继续，而且有增无减，直到开发出有效的疫苗和/或人群免疫力限制病毒传播。

为了帮助扩大测试规模，Illumina最近加入了美国国立卫生研究院的快速加速诊断(亚博下载appRADxSM)的倡议，并将推出我们自己的COVID检测服务。我们相信，这些努力将有助于缩小检测差距，并为病毒控制提供可操作的测序信息。

扩大COVID检测始终是一个巨大的挑战。今年早些时候，哈佛大学萨弗拉伦理中心建议我们这样做6月每天需要500万次测试到秋季，每天的销量将达到2,000万辆。洛克菲勒基金会提议增加到到秋天，每周3000万．其他人则提出了更温和的建议每天500000同时预计会有更大的需求。

但仅靠测试是不够的。这些预测的变化是基于对病毒基本繁殖价值的假设，以及保持社交距离和接触者追踪计划的有效性。这些努力必须同样有力。

截至8月25日，美国报告了7960万次检测9%的整体测试阳性．在过去的两个月里，测试结果介于479000年和927000年．虽然目前的测试能力满足较低的范围，但我们仍然比更高的测试建议低10到20倍。

这是一个持续的紧急事件。成功控制COVID-19的国家很早就接受了检测，并经历了这一过程低检测阳性率(即阳性检测除以所有检测* 100):新西兰0.4%，台湾0.6%，澳大利亚0.6%，韩国1.5%。

的世界卫生组织(世卫组织)建议，阳性率应保持在3%至12%之间，并必须与积极的接触者追踪和隔离相匹配。美国的阳性率为9%，符合世卫组织的标准，但只提供了与其他成功遏制COVID-19的国家相匹配的10%的检测。

Illumina一直专注于帮助我们的客户利用下一代测序(NGS)来满足不断增长的检测需求;然而，我们预计检测短缺将持续，并将开始通过我们的COVID - 19检测服务直接提供帮助。对于消费者，可以通过雇主和卫生机构使用Illumina的COVID检测服务进行检测，价格与大多数基于pcr的检测大致相同。

我们将利用获得FDA批准的用于检测和诊断COVID-19的紧急使用授权的COVIDSeq测试，在美国开发每天4.8万次测试的能力。对于大多数阳性样本，还将开发用于研究目的的SARS-CoV-2全长序列。除了帮助提高美国的诊断能力，该服务还将生成数千个病毒序列。随着病毒的不断进化和疫苗进入临床应用，这一点将变得越来越重要。此外，由于FDA已授权在NovaSeq 6000测序系统以及NextSeq 500、NextSeq 550和NextSeq 550Dx(在RUO模式下)系统上使用COVIDSeq，许多在CLIA认证下进行高复杂性检测的实验室也可以提供诊断结果和SARS-CoV-2序列。大容量测序有可能彻底改变公共卫生接触者追踪和COVID-19和未来病原体的大流行控制。

这些国家获得了最大的成功在控制大流行时，及早进行了检测、隔离、追踪接触者，并在全国范围内采取了保持社会距离的措施。除非可以追踪接触者在确定感染者后的两到三天内有效执行在美国，这些努力可以减缓，但不会阻止病毒的传播。实时国家监测系统有史以来首次能够实现有效的接触者追踪和疫情管理，并突出可能影响诊断和疫苗有效性的病毒变化。

在美国,接触者追踪基本上失败了由于公共卫生基础设施不足、获得诊断检测的机会有限或延迟，以及无症状感染者比例较高。

随着我们的COVID-19检测服务的增加，我们将开始每周生成数千个COVID-19序列。在RADx的部分支持下，这项工作可以与公共卫生工作相结合，使大规模的主动基因组监测成为现实。

这些数据可以帮助学校和企业安全开学，并有助于预防未来的疫情爆发。如果将COVID - 19检测服务纳入公共卫生工作，可以帮助实现国家科学，工程和医学科学院的实现国家大流行病应对战略现代化的愿景。

我为我们取得的成就感到骄傲。我们的许多进步使测序变得负担得起、可扩展和准确，使基于国家免疫系统的诊断检测成为可能，特别是covidq。随着我们推出高通量的Illumina COVID检测服务，以及clia认证的实验室采用COVIDSeq，美国将更好地展示这种能力如何控制当前和未来的大流行。