已经两年了Illumina收购了Edico Genome及其DRAGEN技术。多亏了DRAGEN,我们将测序数据采集和分析减少到一个按钮,简化过程的愿景正在实现,这是如此令人兴奋。刚刚过去的这个星期五,我们庆祝了成立两周年,我想回顾一下我们的发展,并分享我们是如何让研究人员提出新的问题,通过扩大投资组合收集更多有价值的数据的。
此时,DRAGEN与Illumina的测序仪、库准备套件及其全面的软件套件完全集成,使研究人员更容易实现和扩展工作流程。我们很自豪能够与Broad合作开发一个统一的DRAGEN-GATK管道,用于短读变体调用,并使其向社区开放。我们还使DRAGEN能够满足人口规模的需求,发布我们的超快速人口规模队列分析,速度提高了50倍。重要的是,DRAGEN已成为Illumina产品开发的核心组件,转化为新的功能和管道,优化后可与Illumina的上游软件和库准备套件相匹配。我们还在BaseSpace Sequence Hub上集成了完整的DRAGEN pipeline套件,使研究人员能够通过DRAGEN无缝地将数据流传输到云端进行按按钮分析,每个样本的成本很低。通过实现DRAGEN的可访问性,我们看到这个平台被迅速采用,到目前为止,今年已经处理了超过10万个全基因组当量。
也许过去两年最令人兴奋的进步之一是将DRAGEN集成到新的NextSeq 2000系统上,使其能够进行高效、准确的分析,现在还包括测序。但这并不意味着我们要停止甚至减速。作为创新者,我们的工作还在继续。我们的开发团队正在继续夜以继日地工作(这些天主要是在家里),为我们的客户提供更精简和更集成的样本到答案的体验。
最后,当冠状病毒大流行席卷全球时,我们认真而迅速地考虑了如何将最好的工作带到抗击病毒的第一线。在短时间内,我们能够开发和发布Illumina SARS-CoV-2数据工具包这是一套新的数据分析工具和工作流程功能,适用于使用下一代测序(NGS)研究病毒的人,向全球研究界免费提供。重要的是,该工具包利用DRAGEN的速度和准确性来加速传染病监测和疫情应对,包括新的DRAGEN RNA病原体检测管道和用于疫情监测的DRAGEN宏基因组学管道。
我要感谢我的整个团队,我们的客户,合作伙伴和合作者,他们为DRAGEN的发展和进步做出了贡献。DRAGEN在Illumina的头两年非常成功。尽管我很喜欢回顾我们所取得的成就;我更喜欢我们未来的样子。有关我们DRAGEN进展和管道的更多信息,请访问我们的新闻中心.