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细胞和分子生物学,微生物基因组学,微生物学

使用Covidseq™赋予印度的前线Covid-19测试

利用下一代测序来检测Covid-19

使用Covidseq™赋予印度的前线Covid-19测试
2020年8月13日
几乎有240万病例*Covid-19,印度拥有全球第三位最多的案例,并且更高的测试能力对于减轻病毒的持续传播至关重要。新德里首屈一指的科学和工业研究所(CSIR),基因组学与综合生物学(IGIB)研究所评估了Illumina's的能力covidseq™用于检测SARS-COV-2的研究测定。Covidseq,一种基于高通量的下一代测序的测定,通常使用的24小时内产生结果Novaseq™6000.测序系统并与使用本地安装的Covidseq测试进行的高精度和超快速分析Dragen™Bio-IT平台。与定量聚合酶链反应(QPCR)试验相比,IGIB产​​生的数据表明增强的灵敏度,总共8-10%的诊断产量增加。

我们与CSIR-IGIB的合作是我们如何与世界各地的客户合作的重要示例,以便为Covid-19测试提供下一代测序

Covidseq正确鉴定了更多的阳性样本,这种敏感性增加可能有助于减少Covid-19的不准确诊断的数量,因此限制病毒的扩散。IGIB的验证提出Covidseq可以是用于检测SARS-COV-2的高度敏感的测定。该测定还为整个SARS-COV-2基因组产生序列信息,这可以帮助基于基于遗传的跟踪努力来了解病毒是如何蔓延的。

IGIB正在评估covidseq.希望增加前线测试的可用性,同时还获得可用于监测病毒传播的信息分子流行病学信息。

“CovidSeq验证的完成代表了帮助印度战斗和分类这种破坏性疾病的重要进展,”CSIR-Sourcitute和综合生物学主任Anurag Agarwal表示。“Illumina的技术有可能大大扩大印度的Covid-19测试能力,让我们更接近控制爆发。”

Covidseq确认病毒在症状性的情况下,同时同时测序其基因组,为跟踪Covid-19提供有价值的资源。Covidseq提供的基因组覆盖促进了分离物的遗传流行病学和系统发育分类。这可以提供对流行病的引入和出现的见解,这是基于证据的方法扰乱疾病的蔓延的核心。

Illumina副总裁兼亚太和日本总经理Gretchen Weightman表示:“我们与CSIR-IGIB的合作是我们如何与世界各地的许多客户合作,为COVID-19检测提供下一代测序的一个重要例子。CSIR-IGIB从covid - seq的首次商业验证中获得的结果具有重要意义,因为它表明了抗击COVID-19大流行所需的全球需求和可扩展性。”

*https://coronavirus.jhu.edu/map.html

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