跳到内容

社区,Agrigenomics,微生物基因组,复杂疾病基因组学

土着科学家如何控制他们的数据

下一代测序有助于主权和遗传研究帮助本地国家

土着科学家如何控制他们的数据
8月6日,2021年

在刮风,阴云密布,但三月不合时宜的温暖的一天,Joseph Yracheta很兴奋地欢迎两个客人在南达科他州Eagle Butte的研究设施。Illumina田间应用科学家Brittny Smith和Field Service Engineer Andrew“AJ”Rutt正在寻求帮助Illumina的设置nextseq™550已作为Illumina加快基因组学企业社会责任倡议的一部分交付。

Yracheta是的董事总经理原生生物资料协会(NBDC)是第一批非营利组织研究所,由美国土着科学家和部落社区成员领导和人员。自2018年成立以来,联盟的目标是确保当地人可以从遗传和健康研究的进步中受益。NBDC的更广泛的愿景是储存和研究研究样本,不仅涉及人类健康,还具有环境和农业健康。

从历史上看,基因组研究已经利用了欧洲血统人群的样本,并且到这一天,土着人民的基因组不得很好地代表。这种采样总是偏离数据并在具有欧洲血统中的个人中常见的疾病和遗传变体之间的关联。精密药物,使用个人遗传学划分治疗过程,仍然主要有利于欧洲血统对群落的群体。

“部落表示数据和生物多样性的未被利用的资源。”

美国原住民遭受一系列健康差异,包括糖尿病,心血管疾病和结肠癌。与美国其他种族相比,原生人群中类风湿性关节炎(RA)的发生率为2.5〜5次。虽然某些关于常规诊断的阴性阴性,但本土患者仍然被诊断为RA,这意味着那些测试的生物亚博下载app标志物并不总是为他们工作,YRACHETA和他的同事们。NBDC的众多研究项目之一是探索本机群体的RA的生物标志物,并根据其遗传调查结果开发新诊断。亚博下载app

在大流行期间,美洲原住民印度社区一直是最艰难的群体。对于没有基础设施的基础设施,他们面临着美国政府的测试和援助延迟。进入大流行病,Illumina捐赠了一个NextSeq 550,旨在补充和加强现有的Covid-19监测努力,监测和预防Cheyenne河赛源部落(CRST)之间的SARS-COV-2传输。除了跟踪病毒外,他们还将能够测试与Covid相关的合并症。

在向Eagle Butte的道路上 - 一个三小时的往返史密斯和Rutt每天从皮埃尔举行每天 - 他们看到野鸡,鹿和一小群野牛。|上面的照片:从左到右,Joseph Yracheta,Krystal Tsosie,Keolu Fox和Guthrie Duchenaux。|照片:Krystal Tsosie

“基因组需要在全球多样性的适当的上下文来解释,我们真的很高兴能够支持这一机会,帮助缩小差距的多样性,”莎朗·维达尔,在Illumina公司企业社会责任的全球领导如是说。“该NextSeq将使NBDC保持样品和数据的本地,这样的结果可以最终有利于他们服务的社区。我们与约瑟夫订婚,因为我们想赋予土著社区应对当前流感大流行,并帮助他们为未来的风险做好准备。”

Illumina公司代表史密斯和Rutt花了两天时间一起NBDC员工乔纳森金,公共卫生硕士研究生的密歇根大学和奥德拉克劳奇,中,微生物的研究生在俄亥俄州立大学最近的硕士学位。虽然Rutt安装NextSeq,校正光学系统,跑测试,以确保流体和所有系统都运行,史密斯去了培训教材,给了软件的一些演示,并开始与金正日和克劳奇仪器非常首轮。

从左至右,约瑟夫Yracheta,Brittny史密斯,安德鲁Rutt和乔纳森·金。

对于yracheta来说,这种访问下一代测序将有助于部落维护主权或自治。“所有这些数据都可能成为未来的知识产权,我想防止来自土着人民的信息。”

目前,Yracheta正在收集来自北部平原部落的样本。他和他的同事在NBDC期待使用Illumina Nextseq研究易感性和对SARS-COV-2的抵抗以及废水中病毒的存在。该团队还在创建土着土地的土壤微生物座。

“部落代表了尚未开发的数据资源和生物多样性,”Yracheta说。“我们觉得来自本地人来自的资源应该使本地人受益,只有当地人可以控制和实施自己的研究时才能发生。在这里寻找解决方案并将其应用是我们的主要目标。“

最近的文章

为高中教室带来复杂的实验室经验
为高中教室带来复杂的实验室经验
专题讨论了综合基因组分析的价值
专题讨论了综合基因组分析的价值
illumina在大流行的前线
视频:illumina在大流行的前线