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病毒成为基因组永久部分后会怎样

发现原生反转病毒和癌症之间的联系,Illuma顺序排列五代San Digo动物园

病毒成为基因组永久部分后会怎样
Myalla和Joey Arru是两个koalas的DNA排序项目照片来源:圣迭戈动物联盟
2024年1月9日
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圣迭戈动物园照顾澳洲以外最大群动物园以其专业兽医护理和数十年野生动物保护工作闻名,科拉人面临的最大挑战之一是Koala反转病毒病毒与无数致命条件相关-可感知细菌感染、白血病、淋巴瘤和其他癌症-北美百分之百的考拉携带研究显示昆士兰州和新南威尔士州100%野牛拥有它,维多利亚州15%至70%也拥有它怎么可能?

人人都是病毒

横向传播病毒-即通过感染传播病毒-外源.这些都是我们最熟悉的那种向生物体体细胞注入遗传代码(非繁殖性), 并诱导生物体复制病毒,

并注入基因代码 生物细胞-精子或鸡蛋万一发生,病毒式脱氧核糖核酸可成为宿主基因组永久部分:内生病毒非横向传播,而是垂直传播,一代代相传

听上去令人震惊,但很常见所有生物都积存反转录病毒脱氧核糖核酸内生反射病毒遗迹占人类基因组的8%而在大多数物种中 病毒整合数以百万计 DNA退化到无法再感染宿主 或引起健康问题病毒杀死宿主 无法从体外传播 自然选择会快速消除

后退病毒从外源到相对无害搭车者之间, 宿主会发生什么? Leibniz动物园野生动物病系主管Alex Greenwood表示:并不知道病毒如何改变,如果有的话, 在此期间更好地适应宿主

诺丁汉大学兽医细胞微生物学副教授Rachael Tarlinton补充道 道 道 道 道 道或快速改变宿主和病毒安顿

所有动物基因组都包括古代病毒残余物-最近合并后,对宿主构成的健康风险越大照片来源:圣迭戈动物联盟

Koalas风险

KoRV是一个不同案例前五万年才开始归化-进化时间标度,即昨天-所以它的一些子类型仍然是外源性,而它的任何尖锐边缘都还没有沙落,可以说是昨天

KoRV子类型A内生性:这就是百分之百圣迭戈动物园和大片野科拉子类型BC等仍然外源化 所有子类型都与严重的健康问题相关几年前 动物园使用PCR测试 短短检测出

帮助koalas自然隔离并每天睡20小时-他们不像动物那样在大型社会群组中自由繁殖动物园野生动物护理专家则使用稳重亲情记录管理遗传多样性,记录动物关系密切程度对每个女性都保留最合适的雄性链表,并一次介绍给雌性链表,直到接受并交

母考拉二岁后性成熟,通常12至14岁在那段时间里,她可以生8到10个婴儿(称为“joeys”),但在野科拉斯族中,chlamydia是一种广泛和恶性不育症幸好很容易检测到 动物园谨慎育种管理 使他们的人口免入

然而,所有考拉人仍极易患癌症圣迭戈动物园联盟高级兽医Cora Seroneton描述它突然发生并令人心碎:似常次显示次日显示隐微行为变换验血骨髓发现晚期癌症 快速发展

KoRV与这些健康问题相关联,并广泛假设是什么原因,但需要更多基因组研究来消除这一空白。悉尼大学野生动物健康和病理学教授Damien Higgins表示 : “ 难证明因果关系”。昆虫常因免疫抑制或机能失常而出现各种条件, 我们看到这些动物高层次的Koala反转病毒相关联,

Illuma和San Diago动物园测序项目将代表迄今所有koala基因组数据库中最大小数组照片来源:圣迭戈动物联盟

ecervekoala逆向病毒排序项目

2021年,Greenwood、Tarlinton、Slistton、Higgins和澳大利亚博物馆野生动物基因中心管理员David Alquezar担任东道主二次Koala病毒讲习班帮助多科性讨论KoRV和koala管理

研讨会最终建议之一确认需要跨代纵向研究以调查这些健康状况的遗传因果-2023年Slistton联系IConservei

圣迭戈动物园保存着大多数考拉的遗传样本,包括前几代人中许多从1970年代一直追溯到当前人口创建者-Illuma全方位测序这些数据遍历五代人,极有价值Alquezar解释道:「这是一个闭合系统,纵向研究 真正切合此案例归根结底,项目将代表迄今所有koala基因组数据库中最大小数组

研究将比较动物园小段已知死因与排序数据显示的任何KoRV整合模式,以观察特定集成网站与负健康结果关联的强度slistton解释道, “如果我们看到特定kRV整合模式与过去koalas中某些癌症相关联,我们也许能预测未来哪些koalas将冒较高风险开发这些癌症 。 ” 信息类信息对在野生动物护理专家规划最优育生时考虑至关重要

知识会为野生动物圈管理决策提供参考marsials自然栖息地范围近些年来大片分治,部分原因在于2019年和2020年澳大利亚遭遇可怕的野火离散群导致基因多样性下降和对疾病的抗药性下降保护工可以将特定动物从一组移到另一组增加遗传多样性,并避免向以前不存在的人群引入KORV子类

发现抗反转录病毒集成网站是否与免疫基因相关对研究大有裨益Alquezar表示,令我们理解内分化机制 如何实际引起疾病 非常有趣使用此特殊模型能解密并可能成为保护问题的一个重要因素。”

即便病毒内分解是动物进化的自然部分,人类也有责任消除动物生存的其他风险。照片来源:圣迭戈动物联盟

干预或非干预

研究动物基因组中无处不在的抗逆转录病毒脱氧核糖核酸,科学界提出了人类是否应干预慢和似不可避免的KoRV内分解过程的问题。参与iConserv研究者确认我们在此案例的集体责任

希金斯说,“是的,这是一个自然过程, 但它在非自然环境上演由我们来创造环境 自然过程可以展开从进化角度讲, 很难适应的东西 如果你有所有这些压力并专注于消除其他风险以允许他们应对。”

斯列顿同意随着时间的推移,我们期望koala适应这种内分化病毒在此之前,koalas受KoRV威胁,并受栖息地损耗和分片威胁KORV无法从Koalas清除,

至此,项目排序阶段完全完成,Leibniz学院博士后生物信息学家Guilherme Neumann已经识别出超过1500KoRV插入91次动物序列与预期相对小动物园群相比,这些koalas通常分享更多KoRV集成网站Greenwood表示, “ 有趣的部分现在是看共享集成是否泛指基因组中伤害较少的部分-如果有的话,聚焦那些分享较少的部分,后者可能包含问题越大KoRV集成最终可能成为潜在管理目标

同时,Slistton乐观地认为,这项研究可成为考拉保护的转折点。多年以来,我们知道北美考拉人数据中有一些非常特殊的东西, 但是我们一直无法获取技术分析它,透过我们与Illuma的伙伴关系, 我们正在实现研究目标 似乎无法实现回溯2021年yobet亚洲聚集这个国际团队向科拉族学习帮助科拉族本族范围, 对我来说是一个职业顶点,

问题选食

Koalas只吃ecalyptus, 树叶对其他动物有毒yobet亚洲进化出特殊代谢和内脏微生物适配 专门消化它 让他们独家获取食物讽刺地说,这可能是一个原因 它是如此难处理 科拉斯的一些疾病slistton表示:「为了食用ecalyptus,昆虫能够降低许多药效 以至于药效失效

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