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社区,企业,微生物基因组学

视频:Illumina在大流行前线

回顾一下我们是如何部署下一代测序来支持全球监控的

Illumina站在大流行前线
2021年8月26日

这个月,Illumina公司向分子诊断参考实验室捐赠了100万美元用于测序能力在大孟买市政公司运营的Kasturba医院Kasturba位于印度马哈拉施特拉邦,那里有600多万例COVID感染病例,他知道基因组监测是一项关键工具。作为一家全球性的生命科学公司,Illumina的使命是支持改善健康和生活质量。在这次大流行期间,这项任务被放大了一百倍。目前,Illumina为70多个国家的COVID监测提供支持。

从一开始就排序
2020年1月24日凌晨,当他们的家人准备庆祝春节时,Illumina在中国的员工正在整理行李NextSeq™550中国疾病预防控制中心(CCDC)随后,团队对仪器进行了校准,并对CCDC人员进行了培训。这些机器对于帮助中国科学家和公共卫生官员更好地了解新出现的冠状病毒至关重要。

Illumina从第一天开始就采取了亲力亲为的方式:为客户提供产品、工作流程和支持;实现数据和样本共享;为客户实验室配备人员,帮助他们扩大规模;捐赠和打折用品。

我们的员工与美国疾病控制与预防中心、盖茨基金会、美国疾病控制与预防中心、非洲疾病控制与预防中心、巴斯德研究所、制药和生物技术公司以及许多其他机构密切合作,帮助监测和控制病毒。由于Illumina测序技术是全球的NGS标准,我们为所有这些组织提供了共享信息的通用语言。

NGS在流行病学研究、分析感染群、确定共病、验证诊断以及评估不同菌株及其演变方式方面发挥了重要作用。亚博下载app这些片段对于了解这种疾病、测试治疗方法和开发疫苗至关重要。

最早的努力
早在Illumina公司将nexttseq系统交付给中国疾控中心之前,我们的仪器就已经在帮助公共卫生官员抗击疫情。2019年12月,上海公共卫生临床中心(SPHCC)部署了MiniSeq系统对患者样本进行测序。SPHCC是最早发表病毒基因组序列的机构之一。

后来,我们打开了illumina微生物测序研究与应用示范中心加快微生物研究和临床试验。

2020年4月,我们推出了Illumina SARS-CoV-2数据工具包它是一套新的数据分析和工作流工具,使识别患者样本中的SARS-CoV-2序列变得更容易,并将这些发现与公共数据库共享。

为了加速采用,Illumina最初将该工具包免费分发给全球研究团体。这些工具整合了全球15000个Illumina测序系统,为共享信息、了解传播途径、跟踪病毒进化和确定病毒突变是否影响治疗疗效提供了不可思议的资源。

这个月晚些时候,Illumina捐赠了140万美元为非洲联盟委员会扩大在刚果民主共和国、埃及、埃塞俄比亚、加纳、肯尼亚、马里、尼日利亚、塞内加尔、南非和乌干达的SARS-CoV-2测序工作提供测序系统和消耗品。

五月,Illumina和Illumina企业基金会承诺提供1000万美元支持抗疫工作: 500万美元,用于支持SARS-CoV-2监测、测序和监测的仪器和消耗品;200万美元用于与covid -19相关的研究;向疾控中心COVID - 19应急基金提供100万美元;200万美元用于社区倡议。

在英国,是Illumina与英国基因组公司合作对约3.5万名COVID-19患者进行测序。该举措的目的是揭示COVID-19易感性的遗传因素。

NGS新冠病毒检测和监测
6月9日,我们的高吞吐量COVIDSeq™试验获得了FDA的紧急使用授权,为实验室提供了一种新的NGS工具来扩大诊断测试。后来,我们发布了COVIDSeq™试验,我们的研究只使用面板运行在MiSeq, MiniSeq和isq100系统。这种较新的检测方法虽然不是一种诊断方法,但却让小型、分散的实验室能够检测和跟踪病毒——这在没有研究或监测网络的发展中国家是一种特别的需求。

在实验室之外,Illumina在四个大洲都做出了实地贡献。与比尔和梅林达·盖茨基金会合作,Illumina承诺为全球病原体基因组计划提供6000万美元的测序能力该项目扩展了非洲病原体基因组计划,帮助在世界各地创建一个全面的病原体基因组网络。

covid - seq尚未获得FDA的批准或批准。FDA根据EUA授权,在有理由批准紧急使用体外诊断用于检测和/或诊断COVID-19的情况存在的期限内,对该测试进行授权。亚博下载app根据1988年临床实验室改进修正案(CLIA) 42 U.S.C.§263a, covid - seq仅被授权在美国的实验室中使用,以执行高复杂度测试。

有关MiSeq、MiniSeq和iSeq 100系统的新96个样本covid - seq检测方法的信息,请单击在这里

要了解yobet亚洲亚博官网人口更多关于NovaSeq 6000和NextSeq 500/550/550Dx/2000的covid - seq,请单击在这里

要阅读有关支持COVID-19监测的信息,请单击在这里

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