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复杂疾病基因组学,细胞和分子生物学

Illumina精简核酸质量分析

Illumina与先进的分析技术合作,提供可扩展的质量评估解决方案

Illumina精简核酸质量分析
2017年9月12日

高级分析技术,Inc。(Aati)illumina最近签订了一项协议,以支持涉及Aati的合作和共同营销活动Fragment Analyzer™自动化CE系统用于Illumina下一代测序(NGS)工作流程中的核酸质量控制(QC)分析。片段分析仪可以同时鉴定和定量DNA和RNA,从而加速NGS库的制备。AATI的系统提供了一种可扩展的方法,经Illumina测试,用于准确分析Illumina NGS库准备工作流程中的各种样本类型,包括基因组DNA、RNA、无细胞液体活检、单细胞分离物和测序前的准备库。

评估核酸质量对于NGS应用的成功至关重要。可以通过验证在文库制备之前的样品的完整性,鉴定可能产生次优容的DNA和RNA样品产生次优文库,其产生较差,碎裂或低纯度,可以通过验证样品的完整性来实现。类似地,准备的DNA文库的准确质量和数量分析可用于优化测序期间的集群生成,从而节省成本和时间,同时最大化测序数据质量和输出。

Illumina产品营销高级总监Kevin Meldrum说:“片段分析仪系统为我们的客户提供了新的选择,以简化核酸分离物和制备文库的分析。”我们期待着与AATI合作,提供稳健的质量控制解决方案,特别是随着NGS样本数量的增长,以及我们的高容量NGS平台增强了多路复用技术。”

单细胞基因组学的动态领域是驱动NGS样本号的扩展的力。史蒂夫地震,博士,斯坦福大学生物工程和应用物理教授,陈·扎克伯格(CZ)Biohub的共同主席,以及Aati片段分析仪技术的早期采用者。Quake的团队使用片段分析仪进行逆转录的单细胞转录om的高通量分析,以及在测序前对其汇集的IlluminaNextera®库的低通量分析。Norma Neff,Ph.D.在加入CZ Biohub作为基因组学总经理之前,在斯坦福州的斯坦福德博士实施了AATI系统。“片段分析仪是我们单细胞RNA-SEQ管道的重要工具,”Neff博士说。“敏感的定性分析和准确的量化数据使得在Nextera库构造之前的单元输入精确标准化。成品库的片段分析仪QC确保所有Illumina测序平台以高效率产生最佳数据。“

Illumina出版了一本申请书这提供了片段分析仪QC解决方案的概述,用于各种Illumina的NGS库制备工作流程,例如全基因组,外壳,RNA表达,甲基化,扩增子和靶向板。片段分析仪解决方案包括新的质量评估指标FFPE RNA.FFPE DNA这些样本通常是癌症研究人员调查的。

“我们对illumina的兴奋性兴奋,因为他们的变革性NGS技术塑造了个性化医学和基因组发现的现代时代,”Aati商业发展副总裁Jonathan Hagopian说。“我们与Illumina的合作正在提供创新的QC解决方案,可加速工作流程,优化NGS数据生产,并提供关键的样本完整性基准。”

片段分析仪与自动凝胶引发的替代QC系统不同,改善低分子量敏感性,精确的高分子量尺寸,支持低通量测序操作的能力,可伸缩并行分析最多12,48或96个样本,和免提自动化多达288个样品。片段分析器Infinity®该系统与机械臂集成,可连续运行,每天可运行2400多个样本,无需用户干预。

要了解yobet亚洲亚博官网人口有关高级分析技术和片段分析仪的更多信息,请访问:https://www.aati-us.com/instruments/fragment-analyzer/

要了解yobet亚洲亚博官网人口有关Illumina应用程序的QC QC的更多信息,请访问://www.169o.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/appnotes/library-qc-fragment-analyzer-application-note-770-2017-002.pdf

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