微生物基因组学、精密健康学、微生物学

预防术后感染一次NGS解析

在世界AMR认知周期间,新研究显示NGS引导治疗比标准护理多预防感染

预防术后感染一次NGS解析
11月17日

肾石外科手术,包括立方形手术,都与后院感染风险相关国家卫生院估计60万肾石操作去年在美国演练其中约42,000名病人感染其中一些感染被称为化粪事件可能威胁生命微生物从膀胱传播到流水时发生这些严重感染化粪事件医疗急救需要住院医疗事务副总裁Nick Sanford表示 :microGenDX.

亚博下载appmicleGenDX基础为德克萨斯州Lubbock,它是一个200名雇员实验室,侧重于挑战性感染诊断从全美和全地球接收样本并每周运行约2 000样本桑福德通过工作听到无数故事 这些人去门诊日外科2019年自生自灭后,不得不送医院治病E.西里岛受感染治疗后,她的文化测试反转阴性,但她仍住院并有相同的化粪药状状文化清晰,他们说它不再是感染,而是ICUdrium, 而这完全没有意义我, Sanford说一个月来从医院取样本 医院尚未与MicroGenDX签约终于取到样本后,使用下一代排序并发现范康素抗内科科克斯内有标准方法缺失3天后恢复并回家

防生素被认为是临床最佳做法 消解萌芽中这些潜在严重感染当病人去肾石操作时,标准程序要求取尿样以确定他们是否主动感染或高风险术后感染样本寄送文化测试以确定应开哪类抗生素(如果有的话)一次性术前剂量以减少程序后严重感染的风险可惜尿液文化有其局限性

microGenDX生物统计主管Craig Tipton解释道:或治疗团队剩下的工作就是 研究教程建议 和指南适合人造模`我该给谁抗生素' 石术常使用cefazolin,但Tipton表示药对一些人无效

动物肿瘤学博士Michael Liss在圣安东尼奥得克萨斯大学健康科学中心自学时目睹了这一点。与感染风险和抗微生物抗药模式惊人上升密不可分

挑战当前护理标准
2019年12月至2022年1月MicroGenDX与Liss合作确定NGS微生物剖析是否能帮助选择预防抗生素并实际减少感染Liss主编研究,最近发布欧洲乌鲁科开放科学.

对比效果测试涉及157块极石立体病人的双臂,均有负文化测试结果一只臂遵循护理标准程序并配方抗生素,没有任何基因组数据或信息指导选择二臂病人接受NGS测试指导选择预防抗生素一位传染病药剂师查看NGS结果帮助推荐

护理标准病人的感染率为8.5%受NGS引导干预臂中,协议执行对象的感染为零有例医生不开NGS引导抗生素干预臂意向对处理分析包括该病人仍然发现1.3%的感染率大大下降

NGS测试会增加标准尿液培养成本,但其价值可以用其他方式显示。论文显示MicroGenDX检验费用249美元,但化粪事件增加尿素检验费用31 843美元Sanford计算出中型医院每年约1000立特里比斯可省下约150万新元NGS测试还可以降低风险、时间和病人痛苦

Tipton表示开抗生素使用经验指南可归结为“高概率猜法你可以用NGS跳过猜想题

yobet亚洲依赖文化测试还可能帮助泌尿科和微生物科更多了解感染生物学男性更需要肾石操作,研究作者发现,妇女患术后感染的可能性比男性高十倍Tipton表示:「我有点震惊,与男子相比,妇女微生物剖面数和类型差别极大常识抗生素为男性效法 几乎不为女性效法

研究发现NGS引导处理支持更多个性化和多样性使用抗生素抗生素使用增加9.3%,同时使用两种抗生素的情况增加8.1%,而未接受NGS测试的群体则增加8.1%-抗生素管理似似反直觉性Liss解释该组8.5%受感染风险的偏差表示:“通过快速精确识别病原体,NGS帮助我们预防不必要的或无效抗生素处理,降低抗药性开发风险。工具库中重要工具 用于早期检测和定向管理

增长AMR危机
抗菌抗药性指微生物抵抗能力,往往通过突变、抗生素或其他药-使其无效这使得感染难或难处理有限数目前核准的药历史过量使用其中一些药物被认为创造了环境,使得抗菌抗药性更可能出现抗生素原意解决感染问题正成为问题的一部分:窝藏抗药性的有机体更有可能在医院等环境传播

Sanford反射自生自死经历的更广泛影响:“他们不仅改变抗生素,接受测试可能不仅能救她,而且还能救邻房中几个其他病人。 ”对于他来说,整个经验都强调了NGS的重要性。那天我送她去看医生时 从没想过会变成ICU那时我看到了技术的力量 自那以后我一直是大支持者

世界卫生组织确认世界AMR周11月18日至24日,主题为“共同预防抗菌性抗药性 ” 。 据估计2019年近500万例死亡与细菌ARM相关联,包括127万例直接死亡

需要跨职业村
Lis认为预防感染和AMR的关键是使用NGS和跨功能团队NGS引导修改抗微生物预防综合需要微生物学家、临床医生和药剂师的协同努力通过促进协作,我们能够在诊断能力快速提高与负责任地使用抗生素之间求得平衡

Lis目前申请赠款将研究扩展至多中心,并附加目标,例如收集实际肾石样本以测试一致性并理想地实施框架跟踪病人费用、医院资源使用等

经验重构未来视觉, 特别是从我们如何设想诊断管理实践上,

Lisss等研究帮助研究界 研究界和医学界 越来越多地使用NGS2024年初MicroGenDX将从7000平方英尺实验室扩展至2万平方英尺以上设施亚博下载app更好的诊断方法即将上演,NGS测试可能起作用

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