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Rarebase正在寻找治疗机会

加州一家公司的精准医疗平台同时研究了数千种罕见遗传疾病

Rarebase正在寻找治疗机会
Reyna, Jainu和Shruti Jogani |图片:Jaime Borschuk
2022年10月31日,

旧金山湾区的居民Jainu和Shruti Jogani让他们刚出生的女儿Reyna在家里呆了近三周,他们注意到她出现了类似癫痫发作的症状,发作得如此之快,以至于无法用视频捕捉到。正常的血液检查、核磁共振扫描和心电图都恢复正常,除了癫痫的基因图谱。此外,视力下降等症状持续存在,家长们做好了最坏的打算。

当莱娜的基因测序结果在她三个月生日前后发现她缺乏CDKL5时,吉努和什鲁蒂开始理解等待他们家人的充满挑战的旅程。他们选择了全基因组测序,以更好地了解突变的程度,并可能有助于研究基础上的治疗方案,如反义寡核苷酸(ASO)。这种罕见的疾病是由其同名基因突变引起的,每4万到6万新生儿中就有一人患有这种疾病,而且奇怪的是,约90%的确诊患者是女孩

在一次罕见病家庭聚会上,吉努遇到了Onno Faber和Omid KarkoutiRarebase该公司是一家精准医疗公司,致力于为患有罕见基因疾病的人寻找治疗机会。这一介绍促使Rarebase与非营利组织合作Hope4Harper该基金会支持针对CDKL5缺乏症儿童的研究。

这种疾病的特征是婴儿期开始的癫痫发作和发育迟缓,现在是Rarebase研究组合中罕见的遗传疾病之一。Rarebase也位于旧金山湾区,成立的目的是为医疗服务不足的罕见病社区开发一种更可扩展的药物发现方法。该实验室目前有7名研究人员和2名工程师,由Chris Moxham博士领导,他是一名在罕见疾病临床阶段药物开发方面具有专业知识的药物搜寻者。

Rarebase联合创始人兼首席运营官Omid Karkouti与Jogani家族以及Rarebase探索研究总监Sabine Topka博士。

生物医学研究的大数据革命使Rarebase能够以一种新颖的方式解决罕见病药物研发的空白:在一个单一的研究平台中研究数千种罕见遗传疾病,该平台被Rarebase命名为Function™。利用这些数据,该团队可以绘制出针对个别疾病的精准医疗机会,并全面评估罕见遗传疾病的空间。

功能确定药物候选,可针对的根本原因生物学罕见遗传疾病。通过针对这些根本原因,该公司的目标是在解决每种疾病的多种症状的同时,“重新平衡失调的基因表达”,并最终在基因定义的罕见疾病的整个领域加速发现。

“利用我们的功能研究平台,我们正在寻找大约2700种fda批准的药物的效果与每种疾病的潜在生物学之间的匹配,”Faber说。为了对Function进行药物筛选,Rarebase的研究人员使用了IlluminaNovaSeq™6000而且NextSeq™2000执行基因表达读出。下一代RNA测序使Rarebase团队能够从系统层面对每种罕见遗传疾病(包括CDKL5缺乏症)的潜在生物学进行研究。他们预计,这种程度的细节将全面改进药物预测。“我们正在努力扩大我们的数据集,以覆盖更多的治疗领域,通过对更多的细胞类型进行筛查,并开发从我们当前的数据集推断的方法。”

关于雷纳的病情,他解释说:“到目前为止,我们已经确定了几种有希望改变的候选药物CDKL5基因的表达。这些候选化合物需要额外的评估,所以下一步是在细胞模型中测试这些化合物CDKL5基因变异。”

Rarebase让患者和家属参与到研究的每一个阶段。他们与雷纳这样的家庭合作,这样患者社区就可以尽早为他们所爱的人找到治疗机会。到目前为止,Rarebase团队已经完成了近4000种化合物的初步筛选——其中超过一半是fda批准的——并为他们目前正在研究的27个患者群体确定了初步的药物再利用候选药物。

照片:Jaime Borschuk

莱娜现在四岁了,吉努说,了解她的CDKL5突变有助于他们更好地进行精准医疗和他们可用的选择:“我们对我们的莱娜有很大的期望。人们认为我们疯了,但我们希望她能独立生活,上学,上大学,组建家庭,过她想要的生活。这将是一项挑战,但随着医学的进步,我们认为这并非不可能。”

Jainu和Shruti成立CDKL5南亚在该地区,CDKL5缺乏症的可能性是美国的三倍,但基因检测却不太方便。他们正在帮助医院区分它和Rett综合征,后者是一种特征相似的疾病;提倡制药公司对潜在的治疗药物进行试验;努力消除与这种罕见的、使人衰弱的疾病相关的耻辱,这样孩子们就能拥有最好的生活质量。

Jainu也是CDKL5联盟的主席,该联盟由来自35个国家的团体组成,致力于为患有这种疾病的儿童提供公平的治疗方案。

Faber说,Rarebase成立两年来已经取得了重大进展:“通过大规模应用尖端药物搜索技术,我们正在改变罕见基因疾病潜在治疗候选药物的发现和开发方式——我们对未来非常兴奋。”

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