全面的基因表达和转录组分析方案
转录组分析实验使研究人员能够表征转录活性(编码和非编码)，专注于相关靶基因和转录本的子集，或一次性记录数千个基因，以创建一个细胞功能的全局图。基因表达分析研究可以提供各种条件下积极表达的基因和转录本的快照。
下一代测序(NGS)的能力已经将转录组学的范围从一次询问几个基因转变为在一次实验中分析全基因组的基因表达水平。了解基于ngs的RNA测序(RNA- seq)与其他常见的基因表达和转录谱方法、基因表达微阵列和qRT-PCR相比如何。yobet亚洲学习如何分析基因表达和识别新的转录本使用RNA-Seq。
常见基因表达分析方法
根据您的研究目标，可以使用多种方法来分析基因表达，选择感兴趣的目标和/或分析编码转录组。yobet亚洲了解几种关键的基因表达和转录组分析方法的优缺点。
RNA-Seq
优点：广泛的动态范围，可以应用于任何物种，并可以检测单个测定中的已知和新功能1
缺点：当询问一小组已知的转录物变体的样品数量有限的样本时，可能更易于成本效益
yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于RNA-Seq如何利用RNA-Seq分析基因表达
yobet亚洲学习如何使用以下基于ngs的RNA-Seq方法分析基因表达:
- 信使rna序列通过对编码转录组的清晰、全面的了解，发现替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达模式。
- 有针对性的RNA测序:选择和排序特定的基因或感兴趣的转录本。同时对数十至数千个靶点进行基因表达谱分析。
乳腺癌的基因表达模式
在Illumina Genomics播客的第41集中，Dr. Ake Borg讨论了基于基因表达模式、甲基化和其他基因组改变的乳腺肿瘤分类。
Whole-Transcriptome分析
yobet亚洲学习如何使用全转录组分析和总RNA测序(total RNA- seq)来捕获基因表达变化的广泛影响。这种方法检测编码和多种形式的非编码RNA，以全面了解整个转录组。
yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于Total RNA-Seq利用单细胞转录组测序绘制神经多样性
分析单个细胞的基因表达特征的能力正在改变神经元的分类方式。
差异表达分析
为了了解疾病机制和细胞发育，研究人员经常研究特定组织、发育过程中或在不同条件下的差异表达。与表达阵列相比，RNA-Seq可以检测更高比例的差异表达基因，特别是低丰度的基因。1BaseSpace序列中心应用程序等DESeq2可以帮助研究人员对各种物种的RNA-Seq数据进行差异基因表达分析。
子宫内膜组织单细胞转录组分析
本研究为子宫内膜单细胞基因表达谱研究提供了一条管道。RNA-Seq用于鉴定活检和培养的个体细胞中差异表达的基因。
相关解决方案
癌症基因表达谱
通过RNA测序分析基因表达和转录组变化可以帮助研究人员了解肿瘤的分类和进展。yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于癌症RNA-Seq的信息．
微生物转录组分析
细菌、病毒和其他微生物RNA-Seq实验可以对全面的微生物转录本进行注释和定量。yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于微生物RNA-Seq的信息．
复杂疾病研究
基因表达和转录组分析研究可以帮助研究人员在分子水平上更好地理解神经、免疫学和其他复杂疾病。yobet亚洲亚博官网人口了解有关复杂疾病基因组学的更多信息．
药物反应生物标志物研究
了解如何利用RNA-Seq发现和分析基于rna的药物反应生物标志物。访问旨在帮助研究人员采用此应用程序的资源。yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于药物反应RNA生物标志物分析．
HumanHT-12 v4 Expression BeadChip基因表达阵列已经停产。建议的替代方案包括TruSeq链总RNA，TruSeq RNA外显子组， 和TruSeq mRNA试剂盒RNA-Seq。Illumina始终致力于为您提供高质量的支持和服务。
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额外资源
参考文献
- Zhao S, feng - leung WP, Bittner A, and Ngo K, Liu X. .PLoS One。16; 2014; 9 (1): e78644。