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信使rna序列

mRNA测序介绍

mRNA测序(mRNA- seq)已经迅速成为分析疾病状态、生物过程和广泛研究设计的转录组的首选方法。除了作为一种高度敏感和精确的量化基因表达的手段,mRNA-Seq还可以识别已知和新的转录物亚型、基因融合和其他特征以及等位基因特异性表达。mRNA-Seq提供了编码转录组的完整视图,不受先验知识过滤器的限制。

mRNA-Seq 3个简单步骤

用这种无缝工作流程解决方案分析标准mRNA样本中的编码转录组。

查看推荐的工作流

mRNA测序的优势

在分析转录组时,与基因表达阵列相比,mRNA-Seq提供了许多优势。

  • 提供更广泛的动态范围,使更敏感和准确的测量基因表达的折叠变化
  • 捕捉已知和新特征
  • 能否应用于广泛的物种
从阵列到mRNA-Seq的过渡

表达分析公司开发了工具,使mRNA-Seq结果与之前的阵列数据更容易进行比较。

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准确、高分辨率的转录组视图

比率压缩是基因表达阵列的一个既定技术限制,它会减少动态范围,并可能掩盖或改变测量到的转录变化。1-3 .相比之下,mRNA-Seq不受这种偏差的影响,它对基因表达变化提供了更全面和准确的测量。

此外,mRNA-Seq可以提供链信息,这可以检测反义表达,允许更精确的重叠转录本量化,并增加对齐读取的百分比。

自闭症和mRNA-Seq

SynapDx总裁、首席执行官兼创始人Stanley Lapidus讨论了该公司如何使用mRNA-Seq研究自闭症。

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综合mRNA-Seq工作流

Illumina合成测序(SBS)化学是最广泛采用的NGS技术,产生约90%的全球测序数据

除了行业领先的数据质量,Illumina还提供集成的mRNA-Seq工作流程,简化了从库准备到数据分析和生物解释的整个过程。

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参考文献
  1. 石磊,童伟,苏铮,等。微阵列扫描仪校准曲线:特性和含义。BMC生物信息学。2005; 6 5 2: S11。
  2. Naef F, Socci ND, Magnasco M。寡核苷酸阵列的准确性和精密度研究:在大浓度下提取更多的信号。生物信息学。2003; 19:178 - 184。
  3. Yuen T, Wurmbach E, Pfeffer RL, Ebersole BJ, Sealfon SC。商业寡核苷酸和定制cDNA微阵列的准确性和校准。核酸Res。2002; 30: e48。

*文件中的数据计算。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版