Truseq DNA纳米
生成全基因组测序文库，并使用有限的可用DNA有效地询问样本。阅读更多…
图书馆准备
索引适配器
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为了提供更大的灵活性在订购图书馆准备的单个组件时，我们正在移动到模块化配置。我们现有的TRUSEQ纳米DNA库预备套件（猫。No.FC-121-4001，FC-121-4002和FC-121-4003）将转换为Truseq DNA纳米（猫。24个样品和猫的Cat。No.20015964。用于图书馆制备的96个样本的美国专利No.20015965。指数适配器将单独出售为Truseq DNA单索引（Cat。设置A和Cat的No.20015960。套装B的No.20015961）和Truseq DNA CD（组合DNA CD（Combinerial Dual）指标（Cat。No.20015949）。
Truseq DNA Nano能够高效地询问样品，可用DNA有限。基于机械碎片连接化学，这种低输入法为几乎任何测序应用提供了高覆盖质量和降低的偏差。
通过用基于珠子的选择取代基于凝胶的尺寸选择来简化Truseq DNA纳米，使研究人员能够在不到一天的时间内制定高质量的库。它针对各种读取长度进行了优化，从2×101bp到2×151bp。
TruSeq DNA Nano提供了极好的结果，只需100 ng的输入，消除了对微克DNA的典型要求。这使得研究人员能够研究具有有限可用DNA的样本(如肿瘤样本)，并有助于保存样本以供将来或替代研究使用。除了加快工作流程，基于珠的尺寸选择还避免了与基于凝胶的选择相关的典型样品损失。
Truseq DNA纳米降低典型PCR诱导的覆盖范围的数量和平均大小。增强的工作流程减少了库偏压并提高了整个基因组的覆盖均匀性。这些套件还提供传统挑战的基因组含量的优异覆盖，包括富含GC的地区，启动子和重复区域。这使研究人员能够从每个排序运行访问更多信息。对于几乎任何下一代测序应用，Truseq DNA纳米产品可用于高质量的基因组覆盖范围。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 每次运行1个样品（基于人类基因组的30×覆盖） | 350 BP插入：≤2×100bp 550 BP插入：≤2×150bp |
| HiSeq 2500系统 | 每次运行2-10个样品（双流池；基于30倍人类基因组覆盖率） | 快速运行，350bp插入:≤2 × 100bp 快速运行，550 BP插入：≤2×250bp 输出高，350bp插入:≤2 × 100bp 高输出，550 BP插入：≤2×125bp |
| Truseq DNA纳米 | Truseq DNA不含PCR | Nextera DNA Flex Library Prep Kit | |
|---|---|---|---|
| 测定时间 | 〜6小时总测定时间 | 总检测时间为5小时 | 〜3-4小时（从DNA提取到标准化库） |
| 自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 描述 | 一种低输入研究方法，可提供高基因组覆盖质量和减少偏差。 | 这是一种简单的、无pcr的全基因组测序研究，具有通过基因组挑战性区域进行测序的能力。 | 一个快速、灵活的工作流程，适用于广泛的研究应用和样本类型，从人类到微生物全基因组测序等。 |
| 实践时间 | ~ 4个小时 | 4小时 | 1-1.5小时 |
| 投入量 | 100 ng基因组DNA | 1 ug DNA | 小基因组(如微生物):1- 500ng DNA。大基因组(例如人类):100-500 ng DNA。(关于血液和唾液，请参阅参考指南)。 |
| 的作用机制 | 机械DNA片段和适配器连接。工作流使用较少的偏倚PCR和无凝胶。 | 机械DNA片段和适配器连接。工作流程是无pcr和无凝胶。 | 珠子连接的转座组 |
| 方法 | 通过测序进行基因分型那鸟枪测序那全基因组测序 | 通过测序进行基因分型那鸟枪测序那全基因组测序 | 扩增子测序那de novo测序那鸟枪测序那全基因组测序 |
| 多路复用 | 最多24个单、96个组合（CD）双、24个唯一双和96个唯一双（UD）组合（即将提供） | 最多24个单、96个组合（CD）双、24个唯一双和96个唯一双（UD）组合（即将提供） | 高达384个独特的双（UD）组合和96个组合双（CD）组合 |
| 特殊样本类型 | 低输入样品，不是FFPE兼容 | 不兼容FFPE | 血液，不是FFPE - 兼容，唾液 |
| 物种类别 | 人类，哺乳动物，老鼠，其他，植物，老鼠 | 人类，哺乳动物，老鼠，其他，植物，老鼠 | 任何物种，细菌，果蝇，人类，哺乳动物，老鼠，线虫，植物，老鼠，病毒，酵母，斑马鱼 |
| 物种细节 | 与大多数大的DNA基因组相容。 | 与大多数大的DNA基因组相容。 | 与任何物种兼容 |
| 插入目标大小 | 350 BP或550 BP | 350 BP或550 BP | ~ 500个基点 |
| 规范 | Truseq DNA纳米 | Truseq DNA不含PCR |
|---|---|---|
| 套件类型 | TruSeq-DNA纳米LT&HT | TruSeq DNA PCR游离LT&HT |
| 描述 | 基于广泛采用的TruSeq库prep，降低了输入，提高了数据质量 | 优越的基因组覆盖率，无根化图书馆偏差和空隙 |
| 工作流 | LT套件：手动工作流程 HT套件：自动化友好;手动协议也可用 |
LT套件：手动工作流程 HT套件：自动化友好;手动协议也可用 |
| 输入数量 | 100-200 ng. |
1-2μg. |
| 包括PCR | 是的 | 不 |
| 试验时间 | 5.5小时 | 〜5小时 |
| 实践时间 | 4小时 | ~ 4个小时 |
| 目标插入大小 | 350 BP或550 BP | 350 BP或550 BP |
| 无凝胶 | 是的 | 是的 |
| 支持的样品数量 | 24（LT）或96（HT）样品 | 24（LT）或96（HT）样品 |
| 尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
| 应用程序 | 全基因组测序应用，包括全基因组重新排序，德诺维组装和偏见研究 | |
| 采样多路复用 | 最多24个单一，96个组合（CD）双，24个独特的双和96个独特的双（UD）组合 | |
| 兼容的illumina序列夹 | MiniSeQ，Miseq，Nextseq，Hiseq，Novaseq，Hiseq X，Hiscansq和基因组分析系统 | |
技术说明|PDF <1 MB
技术说明|PDF4 MB.
数据表|PDF11 MB.
