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有针对性的RNA序列

靶向RNA测序介绍

靶向rna测序(RNA-Seq)是一种对感兴趣的特定转录本进行选择和测序的高度精确的方法。它提供定量和定性的信息。靶向RNA-Seq可以通过富集或扩增的方法实现,这两种方法都可以在一组重点关注的基因中进行基因表达分析。富集分析还提供了在许多样本类型中检测已知和新的基因融合伴侣的能力,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。

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靶向富集RNA-SEQ的优点

RNA富集提供了定量的表达信息以及小变异和基因融合的检测。RNA浓缩具有以下特点:

  • 与FFPE组织等困难样品兼容
  • 低输入量(需要10 ng总RNA或20 - 100 ng FFPE RNA)
  • 检测已知和新的融合基因伴侣
  • 基因表达具有广泛的动态范围

Targeted Amplicon RNA-Seq的优点

RNA表达面板可以设计成专注于感兴趣的RNA序列,或自定义内容可以添加到完全优化和实验验证面板。

  • 提供了一种高度精确和特定的方法来测量感兴趣的转录本
  • 为差异表达分析、等位基因特异性表达测量和基因融合验证提供定性和定量信息
  • 同时测量数十到数千个目标
  • 与低质量或FFPE衍生的RNA样品兼容
儿童白血病中癌症通路的新观点

研究人员正在使用TruSight RNA泛癌症小组来了解融合基因在儿童白血病中的作用。

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核糖核酸测序方面的考虑

每种RNA- seq实验类型——无论是基因表达谱、靶向RNA表达还是小RNA分析——对读取长度和深度都有独特的要求。本公告回顾了实验方面的考虑,并提供了帮助研究设计的资源。

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核糖核酸测序方面的考虑

靶向RNA测序与精神分裂症

来自Suny Upstate Medical University(UMU)的Frank Middleton博士(UMU)开发了一个聚焦基因面板,以筛选出在精神分裂症中新发现的CNV引起的表达改变。了解为什么Middleton博士使用有针对性的RNA-SEQ而不是PCR或阵列,以分析与精神分裂症,双相障碍和自闭症相关的几百个基因。

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目标RNA序列工作流

Illumina合成测序(SBS)化学是最广泛采用的NGS技术,产生了全球约90%的测序数据*

我们提供集成的有针对性的RNA-Seq工作流,简化了从库准备到数据分析和生物学解释的整个过程。

基因面板和阵列查找器

识别针对靶向您感兴趣基因的测序面板或微阵列。通过基因搜索面板,或通过基因组位置,变体ID或物种查找基因分型阵列。

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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版