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有针对性的RNA序列

靶向RNA测序简介

靶向RNA测序(RNA-SEQ)是一种高精度的选择和测序感兴趣的转录物的方法。它提供了定量和定性信息。靶向RNA-SEQ可以通过富集或基于扩增子的方法来实现,两者都可以使基因表达分析能够聚焦的感兴趣的基因。富集测定还提供了在许多样品类型中检测已知和新基因融合伙伴的能力,包括福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织。

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靶向富集RNA-Seq的优点

RNA富集提供了定量的表达信息以及小变异和基因融合的检测。RNA浓缩具有以下特点:

  • 与FFPE组织等困难样品兼容
  • 低输入量(需要10 ng总RNA或20 - 100 ng FFPE RNA)
  • 检测已知和新型融合基因合作伙伴
  • 基因表达具有广泛的动态范围

Targeted Amplicon RNA-Seq的优点

RNA表达面板可以设计成专注于感兴趣的RNA序列,或自定义内容可以添加到完全优化和实验验证面板。

  • 提供了一种高度精确和特定的方法来测量感兴趣的转录本
  • 为差异表达分析、等位基因特异性表达测量和基因融合验证提供定性和定量信息
  • 同时测量数十到数千个目标
  • 与低质量或ffpe衍生的RNA样本兼容吗
儿童白血病中癌症通路的新观点

研究人员正在使用TruSight RNA泛癌症小组来了解融合基因在儿童白血病中的作用。

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RNA测序考虑因素

每种RNA- seq实验类型——无论是基因表达谱、靶向RNA表达还是小RNA分析——对读取长度和深度都有独特的要求。本公告回顾了实验方面的考虑,并提供了帮助研究设计的资源。

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RNA测序考虑因素

靶向RNA测序与精神分裂症

纽约州立大学上州医科大学(UMU)的弗兰克·米德尔顿博士开发了一种聚焦基因面板,用于筛查由新发现的精神分裂症中CNV引起的表达改变。看看米德尔顿博士为什么使用靶向RNA-Seq而不是PCR或阵列来分析与精神分裂症、双相情感障碍和自闭症相关的数百个基因。

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针对RNA-Seq工作流

Illumina测序合成(SBS)化学是应用最广泛的NGS技术,生成约90%的全球测序数据

我们提供整合的靶向RNA-Seq工作流程,简化了从文库准备到数据分析和生物学解释的整个过程。

基因面板和阵列发现者

确定针对你感兴趣的基因的测序面板或微阵列。通过基因搜索面板,或通过基因组位置、变体ID或物种找到基因分型阵列。

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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版