关键应用和方法
mRNA测序(mRNA- seq)使研究人员能够更近距离地观察基因表达，并可用于识别异构体、新转录本和基因融合。NextSeq RNA测序解决方案利用经过验证的Illumina技术提供编码转录组的详细快照。每次NextSeq运行最多测序16个转录组。
外显子组测序分析基因组的蛋白质编码区，作为全基因组测序的一种经济有效的替代方案。NextSeq系列的外显子组测序提供了一种简单可靠的方法来识别编码变异，甚至成功测序最困难的基因组区域。每次NextSeq运行序列3-12外显子。
了解研究人员如何将NextSeq系列用于外显子组测序应用。
图书馆准备
1天/3小时动手操作
Nextera基因外显子组
使用一个简单的为期一天的工作流程来提供更快地了解人类Exome的快速路径。
Nextera Flex for Enrichment
Nextera Flex for Enrichment使用快速、用户友好的工作流。珠上标记化学与简化的单一杂交协议相结合，以减少总工作时间。
分析
按钮工具
BaseSpace浓缩应用
用于小，结构和拷贝数变体调用，变体注释和富集度量计算的快速对准和变体检测。
Dragen Encrich应用程序（在BSSH或Dragen Server上）
DRAGEN Enrichment应用程序v3.4.5对齐并可选地调用FASTQ、BAM或CRAM文件，输出BAM、VCF或两者。
NextSeq系列利用经验证的Illumina测序技术，提供高覆盖率以识别整个基因组中的变体。NextSeq全基因组测序（WGS）解决方案通过按钮测序和最少的动手时间，使研究人员能够有效地分析从微生物到人类的任何基因组。序列1人类基因组或每个NextSeq运行最多384个小基因组。
了解研究人员如何使用NextSeq系列对整个基因组进行测序：
分析
按钮工具
Basespace全基因组测序应用程序
使用ISAAC对准和变体呼叫快速从全基因组序列中提取生物学信息。
Dragen Germline Pipeline（在BSSH或Dragen Server上）
DRAGEN生殖系管道v3对齐并可选地调用FASTQ文件，输出BAM、VCF或两者。
DRAGEN体细胞管道(在BSSH或在DRAGEN服务器上)
DRAGEN躯体管道对齐，变体调用仅肿瘤或肿瘤/正常FASTQ文件，输出BAM和VCF。
BaseSpace序列集线器上浏览示例数据集：
nextseq 500 wgs运行
NextSeq 500 WGS项目
更多的应用和方法
微阵列扫描
除了测序外，NextSeq 550还可以为繁殖健康，遗传健康和癌症研究中的广泛应用进行微阵列扫描，包括甲基化分析英飞纳姆MethylationEPIC BeadChip。
目标富集
使用序列特异性杂交来分析利益基因组区域。
编码转录组分析
使用RNA编码区的序列捕获检测RNA外壳的已知和新功能。
有针对性的基因面板
靶向基因测序面板包含针对感兴趣的特定基因的定义探针集。既有预先设计的，也有定制的面板。
甲基化物测序
通过基于测序的DNA甲基化分析来执行具有高覆盖密度和灵活性的表观遗传研究。
基因分型结果进行排序
通过测序进行基因分型为发现新的植物和动物snp和进行基因分型研究提供了一种低成本的基因筛选方法。
RNA药物反应生物标记物的发现
了解如何利用RNA序列发现和分析基于RNA的药物反应生物标记物。访问旨在帮助新用户采用此应用程序的资源。
甲基化阵列
以单核苷酸分辨率定量地询问基因组的甲基化位点。
