测量基因和转录物丰度;检测编码和非编码RNA中的已知和新特征。靶向杂交去除了丰富的rRNA,将注意力集中在转录组的高价值部分。
量化基因表达,识别编码转录组中已知和新的亚型,检测基因融合,并测量等位基因特异性表达。
分析一组重点关注的基因表达。提供定量表达信息以及检测小变异和基因融合。
使用聚合酶链反应(PCR)扩增子超深测序,分析感兴趣的RNA序列,差异表达分析,等位基因特异性表达测量,基因融合验证。
应用程序 | 产品 | 利益 |
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总RNA测序 | Illumina链总RNA Prep |
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mRNA测序 | Illumina链mRNA准备 |
|
靶向RNA测序 | Illumina RNA浓缩Prep |
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应用程序 | 全转录组 | 信使核糖核酸 | RNA富集 |
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实践时间 | < 3小时 | < 3小时 | < 2小时 |
周转时间 | ~ 7小时 | 6.5小时 | < 9小时 |
输入 | 1 ~ 1000ng标准质量RNA;10ng为最佳性能和FFPE样品 | 25至1000纳克标准质量RNA | 10ng标准质量RNA;20ng RNA用于低质量/降解/ FFPE |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
PCR协议 | 没有 | 没有 | 对 |
图书馆数量需要多少? | 对 | 对 | 对 |
包括碎片? | 对 | 对 | 不是必需的 |
产品 | Illumina链总RNA Prep | Illumina链mRNA准备 | Illumina RNA浓缩Prep |
所有三种试剂盒都允许您通过在单个NovaSeq S4 Flow Cell上装载多达384个样品来降低测序成本,使用384个独特的双指标进行更高的通量测序。
珠链转座体标记是一种创新技术,用于我们的图书馆准备组合。通过同时对gDNA进行片段化和添加Illumina测序引物,珠上标记法可以让您更快地获得序列准备库。在没有辅助试剂或设备的情况下规范化您的库。减少周转时间和复杂性。
亚博官网人口NGS库准备中使用的另一项关键技术是适配器连接,这项技术长期以来以一致、高质量的数据而闻名。文库是通过将gDNA或cDNA样本片段化并将专门的适配器连接到片段两端来制备的。这些适配器包含完整的测序引物杂交位点。这样就不需要额外的PCR步骤,使过程完全自动化。
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两种流行的RNA文库预备试剂盒之间的关键比较揭示了RNA测序研究人员感兴趣的新信息。
一套全面的NGS分析方法:
这篇文章集合描述了RNA测序的各种NGS方法,由科学文献汇编,包括正反两方面,发表摘要和参考文献。
增加每次运行测序的样本数量,并使用唯一的双索引适配器优化高通量测序。
独特的分子识别器(UMIs)提供错误校正和准确性,并可以减少假阳性变异调用,同时增加变异检测灵敏度。
我们的合作伙伴已经开发了高吞吐量和低吞吐量的自动化方法,这些方法跨越了我们的库准备组合。
在没有预先知识的情况下,在单一检测中检测已知和新的特征,包括转录本亚型、基因融合和单核苷酸变异。