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COVID-19宿主遗传学和免疫反应分析

冠状病毒

研究COVID-19宿主遗传学

揭示与COVID-19宿主易感性相关的潜在遗传因素,并分析个体免疫系统反应,可能有助于解开疾病的复杂性,并揭示未来的治疗靶点。识别与COVID-19疾病严重程度相关的遗传变异,研究免疫反应差异(如炎症细胞因子、T细胞和NK细胞基因表达特征)至关重要。下一代测序(NGS)和微阵列技术可以帮助研究人员询问宿主遗传变异,并描述驱动免疫反应的分子机制。

使用Illumina NGS和阵列技术研究宿主风险和免疫反应的主要好处包括:

  • 可伸缩性和灵活性筛选不同的样本集,具有高吞吐量和低吞吐量选项
  • 采用多组学方法分析宿主遗传变异并分析免疫转录本和表观遗传特征的解决方案
  • 与项目规模相匹配的数据分析和解释解决方案

宿主遗传学和免疫反应谱研究方法

应用程序 球门 推荐方法
宿主基因研究
  • 确定宿主遗传风险因素
  • 识别与严重新冠病毒-19防护相关的变异
宿主免疫反应分析
  • 了解免疫反应的生物学/机制
  • 识别与疾病进展相关的免疫生物标记物
  • 免疫应答相关基因(如细胞因子)的表达谱
  • 研究免疫相关基因的表观遗传差异
微生物组与宿主反应
  • 研究微生物组在COVID - 19患者中的作用
SARS-CoV-2识别
covid - seq Assay(96个样本)是一种低到中通量的NGS检测方法,旨在帮助临床研究实验室识别已知和新的SARS-CoV-2毒株。
网络研讨会:新冠病毒-19宿主遗传学倡议

马克·戴利博士讨论了一项全球努力,以确定宿主基因对新冠病毒-19疾病易感性和严重性的贡献。

查看网络研讨会

利用基因组学研究新冠病毒-19宿主的遗传变异性

Lee Murphy博士在爱丁堡大学的核心实验室应用基因组学的方法来研究SARS COV-2住院患者疾病进展和结局中的宿主遗传变异。该团队和合作者对DNA样本进行基因分型和WGS,并在NextSeq 2000系统上进行mRNA测序。

查看视频
甲基丙胺与临床结果的关系
甲基化阵列为COVID-19和其他传染病的研究增加了另一个维度。

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与新冠病毒-19相关的DNA甲基化变化
阅读案例研究
COVID-19的免疫学:当前的科学状况
阅读评论
患有严重新冠病毒-19的年轻男性中存在遗传变异
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通过单细胞分析确定,新冠病毒-19严重程度与气道上皮-免疫细胞相互作用相关
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对人体内外微生物群落的研究使研究人员能够了解微生物在健康和疾病中的作用。

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一种DNA测序方法,能对给定的复杂微生物样本中所有生物体的所有基因进行全面取样。

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