2020年9月14日
根据一项开创性举措，澳大利亚公共卫生实验室将致力于对澳大利亚所有COVID-19阳性检测的病毒基因组进行测序，并在全国范围内使用基因组学，而不是逐个州跟踪COVID-19。
自2019冠状病毒病大流行开始以来，Illumina的下一代基因组测序技术(NGS)一直被用来支持研究，包括治疗和疫苗开发、诊断、筛查和监测应用。现在，Illumina正在与传染病基因组网络(CDGN)合作，利用NGS跟踪澳大利亚的COVID-19，这使得实时数据共享和整合能够更好地了解病毒的传播和传播。
由于下一代测序技术的精确性，这项研究将为我们提供更好的理解COVID-19的行为、传播和进化。
新南威尔士大学的联合教授、高级医学病毒学家Bill Rawlinson说，该研究项目将解决澳大利亚国家实施COVID-19基因组学的迫切需求。
“由于下一代测序技术的精确性，这项研究将为我们提供更好的理解COVID-19的行为、传播和进化。该项目将使我们能够衡量使用这种技术的影响，不仅针对COVID-19大流行，而且还针对未来的应对措施，”罗林森教授说。
除了通过新南威尔士大学(UNSW)悉尼获得的330万澳元的医学研究未来基金(MRFF)拨款外，Illumina还将为该项目提供价值超过200万澳元的基因组测序系统和相关消耗品。这些系统预计将于下周交付给多尔蒂研究所、韦斯特米德医院、新南威尔士州威尔士亲王医院的韦斯特米德医院和昆士兰州卫生法医和科学服务中心，扩大新南威尔士州、维多利亚和昆士兰州四个主要公共卫生实验室对病原体进行排序的能力，包括COVID-19样本。
Illumina首席医疗官Phil Febbo博士说:“这是一个领先的全球例子，将证明基因组监测在理解和帮助控制COVID-19大流行方面的独特价值，Illumina很高兴能成为这一努力的重要合作伙伴。”“该计划将允许跨州和地区使用生物信息学共享重要的病原体数据，以确保病毒和其他病原体的测序不仅限于本次大流行，而且将继续在学术研究和公共卫生系统中扩展。”
该项目的其他好处包括能够识别澳大利亚人群中COVID-19的突变，从而为治疗和疫苗的设计提供信息，以及能够准确识别持续感染vs .再感染或非活性感染。这对医护人员特别重要，有助于保护一线工作人员和弱势患者的能力。
“CDGN一直在努力建立一个全国综合病原体基因组计划，这将促进该项目的快速实施，确保基因组分析在全国的获取和一致性，”墨尔本大学教授Ben Howden说，他是CDGN联合主席和多尔蒂研究所公共卫生实验室微生物诊断单元主任。亚博下载app“有关导致COVID-19的病毒在全国传播的信息，对于澳大利亚未来的公共卫生应对措施至关重要。”
在全球范围内，Illumina NGS技术一直处于大流行的前线，用于高通量测序，有可能彻底改变公共卫生接触者追踪和COVID-19及未来病原体的大流行控制。Illumina实验室位于英国剑桥与英格兰基因组公司合作新德里基因组学与综合生物学研究所(Institute of Genomics & Integrative Biology)已经对多达3.5万名COVID-19患者的基因组进行了测序验证Illumina的COVIDSeq分析而上海公共卫生临床中心和Illumina最近开业了SPHCC-Illumina微生物测序研究与应用示范中心在上海,中国。为了帮助规模测试，Illumina最近还加入了美国国家卫生研究院的快速加速诊断(RADxSM)计划，并将推出自己的项目亚博下载appCOVID测试服务。
Febbo博士说:“COVID-19疫情提醒我们，国际社会必须加强国家和国际计划，以便及早发现和应对未来的疾病爆发。”
病原体基因组学可以揭示否则可能被错过的信息，包括对COVID-19的行为、传播和进化的快速了解。澳大利亚国家COVID-19跟踪系统将立即应用于疫情调查，包括识别新出现的疫情和传播事件，作为减少社区传播努力的一部分。
