2021年7月27日
“上个月，我们出现了自大流行开始以来（新冠病毒阳性病例）的最大高峰，”该中心医学主任阿德里安·亚历杭德罗·塞巴洛斯·洛佩斯博士说梅里达生物群落. Biomédicos是墨西哥南部唯一一个采用测序技术进行临床应用的实验室，该地区的经济差异极大。但是直到新的Illumina柯维塞克™ 化验他们还没有对SARS-CoV-2病毒进行测序。Biomédicos是世界上最早使用96样本分析的客户之一。在收到试剂盒的几天内，他们对21个样本进行了测序，在该地区发现了15个伽马和3个阿尔法变体。
在尤卡坦州，有相当数量的来自美国和加拿大的退休退伍军人，以及参观梅里达和坎昆附近的游客。塞巴洛斯·洛佩斯想知道游客是否会带来变种。“我觉得很有可能我们在该地区发现了α型或δ型变异病毒。目前在墨西哥，没有强制性的新冠病毒检测进入该国。仍然必须戴口罩。”现在他可以对SARS-CoV-2进行测序，他将能够识别病毒源。
“我们的老年人已经接受了全面的疫苗接种，但40至60岁的人只接受了第一剂。我们需要进行测序，因为我们观察到病毒很容易传播，年轻患者病情更严重。”
Biomédicos急于启动测序以检测其所在区域的SARS-CoV-2。该实验室服务于墨西哥东南端，包括尤卡坦、恰帕斯、塔巴斯科、坎佩切、金塔纳罗。该实验室还向邻国伯利兹提供服务。
购买了Illumina米塞克™对于2020年末的血液肿瘤学，Ceballos López很高兴使用新的柯维塞克™ 化验允许小型实验室参与监测。COVIDSeq分析试剂盒提供试剂，用于制备多达96个样本，以便在MiSeq上进行测序™, 迷你们™, 和iSeq™ 100个系统，比NovaSeq上的3072个样本更易于管理™ NextSeq上有6000个甚至384个样本™500/550/550Dx/2000.
Ceballos López说：“我们将能够识别具有临床意义的变异，也许是一种新的变异。”。
今天，有超过1.91亿例新冠病毒-19病例全世界报道。许多国家正在对其阳性病例进行排序并报告变异，以支持公共卫生管理。但大多数现有的基因组数据来自大型基因组中心，这些中心的实验室具有高通量样本处理能力，而投资于高通量测序仪的资源有限的国家向新冠病毒监测网络提交的数据较少。
COVIDSeq分析为低吞吐量和中吞吐量实验室提供了在较小规模上进行非集中式监测的途径，以对病毒变体进行排序和识别，从而帮助公共卫生机构管理COVID-19大流行。加强监测以发现新出现和流行的变异对全球控制该病毒的努力至关重要。
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