2021年8月6日
在Windy，3月份的阴天，但不合时宜的温暖的一天，Joseph Yracheta很高兴欢迎两位客人在南达科他州Eagle Butte的研究机构。Illumina野外应用科学家Brittny Smith和Field Service Engineer Andrew“AJ”Rutt正在寻求帮助Illumina的设置下一步™ 550已作为Illumina加快基因组学企业社会责任倡议的一部分交付。
Yracheta是该公司的总经理本土生物数据联盟（NBDC），美国第一家由土著科学家和部落社区成员领导和配备人员的非营利研究机构。自2018年成立以来，该联盟的目标一直是确保本地人能够从遗传学和健康研究的进步中受益。NBDC更广泛的愿景是储存和研究不仅与人类健康有关，而且与环境和农业健康有关的研究样本。
从历史上看，基因组研究使用的样本来自欧洲后裔，而到今天，土著民族的基因组还没有得到很好的代表。这种抽样总是扭曲数据，并发现疾病和遗传变异之间的关联，例如，欧洲血统的个体中常见的疾病和遗传变异。精确医学，利用个体的遗传学来描述治疗过程，仍然主要有利于欧洲后裔而不是有色人种。
“部落代表着尚未开发的数据和生物多样性资源。”
美国原住民遭受一系列健康差异，包括糖尿病，心血管疾病和结肠癌。与美国其他种族相比，原生人口中类风湿性关节炎（RA）的发生率为2.5至5次。虽然某些测试对常规诊断的阴性负面，但本土患者仍然被诊断为RA，这意味着那些测试的生亚博下载app物标志物并不总是为他们工作，yracheta和他的同事们。NBDC的众多研究项目之一是探索本机群体的RA的生物标志物，并根据其遗传调查结果开发新的诊断。亚博下载app
在大流行期间，美洲美洲原住民印度社区一直是最艰难的群体。对于没有基础设施，他们面临着美国政府的测试和援助延迟。一年进入大流行，Illumina捐赠了一个NextSeq 550，旨在补充和加强现有的Covid-19监测努力，监测和预防Cheyenne河赛沟部落（CRST）之间的SARS-COV-2传输。除了跟踪病毒外，他们还将能够测试与携带族相关的合并症。
Illumina公司企业社会责任全球负责人Sharon Vidal表示：“基因组需要在全球多样性的适当背景下进行解释，我们非常自豪能够支持这一有助于缩小多样性差距的机会。”。“NextSeq将使NBDC能够将样本和数据保存在本地，从而使调查结果最终惠及他们所服务的社区。我们与Joseph合作，是因为我们希望增强本地社区对当前大流行的反应能力，并帮助他们为未来的风险做好准备。”
Illumina的代表史米斯和Rutt和NBDC雇员Jonathan Kim一起度过了两天，一位来自密歇根大学的公共卫生硕士毕业生和俄亥俄州立大学的一名微生物学研究生Audra Crouch。Rutt安装了NextSeq，校准了光学系统，并进行了测试，以确保射流系统和所有系统都能正常运行。Smith查阅了培训材料，演示了一些软件，并与Kim和Crouch一起开始了仪器的首次运行。
对于yracheta来说，这种访问下一代测序将有助于部落维护主权或自治。“所有这些数据都可能成为未来的知识产权，我想防止来自土着人民的信息。”
目前，Yracheta正在收集来自北部平原部落的样本。他和他的同事在NBDC期待着使用Illumina Nextseq研究易感性和对SARS-COV-2的抵抗以及废水中病毒的存在。该团队还在创建土壤微生物群地图。
“部落代表了尚未开发的数据和生物多样性资源，”Yracheta说。“我们觉得来自本地人的资源应该使本地人受益，只有当地人可以控制和实施自己的研究时才才能发生。找到解决方案并将其应用在这里是我们的主要目标。“
