发布2019冠状病毒病宿主应对研究合作环境

当科学家试图解决COVID-19大流行，在人类宿主应对SARS-COV-2的研究起着至关重要的作用。今天，Illumina公司发布了一个新的协作环境研究COVID-19宿主反应，利用BaseSpace Correlation Engine (BSCE)．该资源为COVID-19研究人员提供了一个环境，使他们能够将其结果置于背景下，加速发现并围绕重要途径、生物标志物和潜在药物候选线索进行假设验证，以帮助应对COVID-19危机。Illumina正在免费提供这一资源，为COVID-19全球研究社区提供评估BSCE的机会，以支持抗击大流行的努力。

该环境包含全套BSCE工具，结合来自冠状病毒动物模型系统的几个预处理数据集，以及最近发布的人类SARS-CoV-2数据。一旦资源可用，将提供更多相关的科学数据。虽然共享数据不是要求，但鼓励研究人员提交数据集以添加社区资源，或强调他们认为应添加的公共数据集，以促进了解SARS-CoV-2宿主反应的原因。

“作为一名非生物信息学科学家，搜索和理解与我的研究相关的大量已发表数据是一项巨大的任务。Correlation Engine使这个过程变得清晰和直接。它现在已经成为我首选的分析管道的一部分。科罗拉多大学盖茨再生医学中心皮肤病学助理教授Enrique Torchia分享道。

平台支持的结果从Illumina的测序和阵列平台，以及从其他实验方法互补数据生成的。各种数据集可以被导入到BSCE系统用于相关性分析，包括基因表达，甲基化，GWAS，蛋白质相互作用和更多。

资源将提供免费的充电半年至SARS-COV-2研究人员，在这里．我们鼓励研究人员通过联系Illumina申请访问，在这里。

视频教程

要查看BSCE如何可以被利用来实例更好地理解SARS-COV-2宿主反应，有关研究人员可以查看的一系列BSCE用户迈克·爱德华兹，博士，恩里克托尔基亚博士和合作者创建视频，在这里．在这些影片开发的数据已在资源已经可用。