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Agrigenomics

甘薯测序工作旨在改善粮食安全

G. Craig Yencho和Bode Olukolu赢得2017年农业更加良好的倡议补助金

甘薯测序工作旨在改善粮食安全
2017年1月18日

自2011年以来,农业良好的倡议已经向使用Illumina技术的研究人员授予了使用Illumina Technology的研究人员,以解决各种基因组学的项目,旨在减轻发展中国家的全球饥饿,营养不良和贫困。支持的研究项目已跨越全球和科学发现的频谱,改善农业植物和食物不安全群众常见的动物的研究。

本周在圣地亚哥举行的动植物基因组大会上,Illumina公司授予北卡罗来纳州立大学的研究人员2017年奖,因为他们计划开发高质量的从头全基因组组装和六倍体甘薯(番薯甘薯).G. Craig Yencho博士(园艺系教授)和Bode Olukolu博士(研究助理教授)将利用这笔资金开发和验证代表全球甘薯多样性的SNP序列。

Illumina农业基因组学副主任Ryan Rapp博士说:“我们很自豪能够继续提供这个奖项,作为推动研究的一种方式,这些研究具有丰富的潜力,可以解决世界上如此多不同地区的营养不良和饥饿问题。”“我们收到的农业更美好计划奖的数百份申请证明了基因组学在解决全球粮食需求方面的重要性。”

甘薯因其对不同气候的适应性,是全球第七大最重要的粮食作物然而,甘薯基因组的高度杂合度和六倍体性质,以及96条染色体,使得性状代代遗传复杂,对利用分子育种技术培育更有营养的甘薯和根据区域需求优化作物构成挑战。

Yencho说:“甘薯在减轻发展中国家的营养不良和饥饿方面具有巨大的潜力。”“果肉为橙色的甘薯就是一个很好的例子。它们的维生素A前含量很高,说明了生物强化主食作物在撒哈拉以南非洲和东南亚抗击维生素A缺乏症方面的有效性。”

Olukolu补充说:“‘更好’计划将帮助我们进一步解开甘薯的遗传复杂性,并支持我们为全球甘薯育种者开发现代育种工具的努力。”

制定20TB数据所需的测序试剂将用于完成De Novo集装项目,并增强SNP呼叫,以帮助在全球范围内开发SNP阵列以用于甘薯繁殖计划。该团队还计划利用现有的合作与撒哈拉以南非洲,亚洲和南美洲的研究人员利用他们的知识,以便在缺乏营养资源的地区改善粮食安全。

[1] Rodriguez-Bonilla L, Cuevas HE, Montero-Rojas M, Bird-Pico F, Luciano-Rosario D, Siritunga D(2014)波多黎各甘薯遗传多样性评估。《公共科学图书馆•综合》。9 (12):e116184。

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