每个流动单元的排序输出*
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3† |
|---|---|---|---|
| 1 × 50 bp | 60 Gb | ||
| 2×50bp | 40 Gb | 120 Gb | |
| 2×100bp | 80 Gb | 240 Gb | |
| 2 × 150 bp | 30 Gb | 120 Gb | 360 Gb |
*基于单个流单元的输出规格，使用Illumina PhiX控制库支持集群密度。
†P3试剂可用于NextSeq 2000仅。
读取每个流单元格的通过过滤器
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3* |
|---|---|---|---|
| 单端读 | 100米 | 400米 | 1.2 B |
| 双端读 | 200米 | 800米 | 2.4 B |
* P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
质量分数*和运行时†
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3‡ |
|---|---|---|---|
| 质量分数 | |||
| 1 × 50 bp | 在1 × 50 bp处，碱基高于Q30≥90% | ||
| 2×50bp | 2 × 50 bp时，Q30碱基含量高于Q30的碱基≥90% | ||
| 2×100bp | 在2 × 100 bp处，碱基含量高于Q30≥85% | ||
| 2 × 150 bp | 在2 × 150 bp处，碱基含量高于Q30≥85% | ||
| 运行时 | |||
| 1 × 50 bp | 约11小时 | ||
| 2×50bp | ~ 13小时 | ~ 19日人力资源 | |
| 2×100bp | 约21小时 | 约33小时 | |
| 2 × 150 bp | ~ 19日人力资源 | ~ 29日人力资源 | ~ 48小时 |
*质量分数（Q分数）是对基本呼叫中错误概率的预测。在整个运行过程中，对大于Q30的基准百分比进行平均。质量分数基于使用Illumina PhiX控制库在NextSeq 1000和2000系统上运行的NextSeq试剂盒。性能可能因库类型和质量、插入大小、加载浓度和其他实验因素而异。
†运行时包括NextSeq 1000或NextSeq 2000系统上的群集生成、排序和基本调用。
-P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
关键应用程序的估计样本吞吐量
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3* |
|---|---|---|---|
| 小型全基因组测序(300周期) 130 Mb基因组；>30×覆盖率 |
~ 7 | ～30 | ~90 |
| 全外显子组测序（200个周期） 50×平均目标覆盖率;90%的目标覆盖率为20倍 |
~ 4 | ~ 16 | ~ 48 |
| 单细胞RNA序列（100个周期）† 4k cell, 10k-50k read /cell |
~2-10 | ~ 6-30 | |
| miRNA-Seq或小RNA分析(50个周期) 11 m读取/样品 |
~108 |
* P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
†推荐的单细胞RNA-Seq测序深度将在很大程度上取决于样品类型和实验目的，将需要为每个研究进行优化。
NextSeq 1000和NextSeq 2000
规格
仪器配置
- 独立的干燥仪器与集成的DRAGEN Bio-IT FPGA二次分析
仪表控制计算机
- 基本单位:位于仪器内部的2U微服务器
- 内存:288 GB
- 硬盘类型:3.8 TB SSD硬盘
- 操作系统：Linux CentOS 7.6
操作环境
- 温度:15°正在°C
- 湿度:相对湿度20%-80%，不凝结
- 海拔：0-2000米
- 只供室内使用
激光
- 波长:449 nm, 523 nm, 820nm
尺寸
- 宽×深×高：60厘米×65厘米×60厘米
- 体重：141公斤
用板条箱包装的尺寸
- 板条箱宽×深×高：92厘米×120厘米×118厘米
- 板条箱重量：232公斤
功率要求
- 仪器输入电压:100Vac ~ 240Vac
- 仪器输入频率:50/60Hz
网络连接的带宽
- 200 Mb/s/仪器用于内部网络上传
- 200 Mb/s/仪器用于BaseSpace序列集线器上载
- 5 Mb/s/仪表用于仪表运行数据上传
产品安全及符合性
- 安全:1级激光产品
- NRTL认证委员会
- 61010 - 1 CE标志
- FCC/IC批准
NextSeq 1000和NextSeq 2000
墨盒
易于使用的cartridge-based平台
NextSeq 1000和NextSeq 2000测序系统利用了集成的墨盒，包括试剂、流体和废物容器，简化了文库加载和仪器使用。只需解冻试剂盒，将流动细胞插入盒中，将库装入盒中，并将组装好的盒插入仪器中。
NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动单元
增加输出
为了充分利用更高密度的流池，NextSeq 1000和NextSeq 2000测序系统采用了一种新型的超分辨率光学系统，与传统的台式系统相比，该系统可以产生更高分辨率和更高灵敏度的高精度成像数据。这种小型化提供了多种输出量的可伸缩性，同时保持了NextSeq 550 System用户今天所享有的相同的高数据质量标准。
NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动单元
增加输出
为了充分利用更高密度的流池，NextSeq 1000和NextSeq 2000测序系统采用了一种新型的超分辨率光学系统，与传统的台式系统相比，该系统可以产生更高分辨率和更高灵敏度的高精度成像数据。这种小型化提供了多种输出量的可伸缩性，同时保持了NextSeq 550 System用户今天所享有的相同的高数据质量标准。