了解罕见病的基因组学可以帮助医生查明未诊断疾病的原因,帮助家属避免数年的医院就诊和不必要的检查。尽管世界各地对罕见病的定义各不相同,但每2000人中就有1人患有罕见病。1、2已知的罕见疾病有7000多种3.每年都有更多的发现。总人口的2-6%(1.5亿人)受到一种罕见疾病的影响。3、4、5
平均来说,寻找罕见疾病诊断的漫长过程——“诊断奥德赛”——需要5到7年,68医生,72到3个误诊。7鉴于80%的罕见病是遗传的或具有遗传成分,全面的基因组测序增加了发现患者潜在病因的潜力。8下一代测序(NGS)提供了罕见疾病诊断的最高可能性9、10也是结束诊断漫长旅程的最快途径。9
基因组学正在推动罕见病诊断的根本性转变,从症状分析到分子病因学评估。了解疾病的生物学基础可以带来更好的护理和有针对性的治疗,产生可预测的、循证的结果。这种罕见病基因组学中的分子诊断是精准医学的基础。
罕见病的分子诊断是一个关键步骤,可以使患者、其家属、医生和其他医护人员受益。根据美国遗传与基因组学学院(ACMG)的说法,确定个人疾病的遗传病因对患者、他们的家庭和整个社会都是有用的。11
了解罕见病的发病机制可以让医生将患者转诊给合适的专家,选择量身定制的治疗方法,并提供针对特定疾病的随访。
通过避免漫长的诊断过程,罕见病的基因组诊断可以帮助避免昂贵的检测和程序,并限制不必要的转诊。
确定一种罕见疾病的遗传模式可以告知患者及其直系亲属和大家庭的复发风险,支持知情的计划生育。
除了避免与诊断长途跋涉相关的压力之外,接受分子诊断还将受影响的家庭聚集在罕见病支持小组的社区中。
了解罕见病的基因组学可以帮助确定新的药物靶点和提高护理效率。
全基因组测序是罕见病检测最全面的方法。它检查整个基因组,并有能力评估基因组编码和非编码区域的变异。第12 -
全外显子组测序评估外显子,基因组的编码区域,与疾病相关的变异。9, 10年,20年
靶向测序分析与罕见疾病或罕见疾病家族相关的特定基因。
染色体微阵列(CMA)技术可以识别基因组中较大的染色体变异和特定的、描述良好的变异。
诊断率是最常用于比较罕见疾病基因组检测方法的统计数据。这是指一项检测提供建立分子诊断所需信息的可能性。根据被研究的患者群体和纳入标准,诊断率可能有显著差异。
在大多数研究中,全基因组测序(WGS)是所有方法中诊断率最高的。它广泛覆盖了基因组(> 97%),并能够检测多种变异类型(单核苷酸变异、内链变异、结构变异、拷贝数变异、重复扩增、线粒体变异和谬误)。第12 -
全外显子组测序(WES)是第二高的诊断率。与WGS相比,WES的基因组覆盖率更低(约占基因组的1.5%),检测到的变异类型更少。然而,WES比WGS更便宜,而且通常有更高的偿还率。9, 10年,20年
罕见病的靶向测序评估特定基因。最大的面板覆盖了不到0.5%的基因组。
染色体微阵列方法覆盖不到0.01%的基因组。CMA特别关注具有良好特征的致病变异的基因组区域。CMA的诊断率明显低于WES和WGS。9
本课程提供了儿科罕见病的概述,可用的检测选择,和基因组测序的临床实施。它可能与实验室提供者、医疗保健提供者、医疗保健组织和其他对罕见病人群基因组学综述感兴趣的人有关。这门课程是通过Illumina的教育资助才得以实现的。
查看课程详细信息蓝十字蓝盾协会技术评审组织Evidence Street®发布了一份支持全基因组测序的积极评价。
该试点项目通过快速查明罕见疾病的病因,为重症监护中的婴儿提供服务,为婴儿和家庭带来希望。
NICUSeq是一项多中心研究,评估全基因组测序是否能改变急性新生儿的临床护理。
在这期播客中,澳大利亚无名综合征(SWAN)的Heather Renton讨论了她女儿的罕见疾病、诊断的艰难历程和NGS的影响。
COVID-19给面临罕见疾病的家庭带来了额外的挑战。我们认识到罕见病界的这一负担,并继续致力于结束诊断的奥德赛。
树宝小时候患有高氧血症。全基因组测序在他的两个拷贝中都发现了一个变异PDHX基因,导致了量身定制的治疗。他几乎立刻就有了进步。