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罕见的疾病基因组学

致力于结束罕见疾病的诊断之旅

卫生保健领域的技术创新和合作,以确保家庭及早得到诊断

罕见病基因组学和精准医学

了解罕见病的基因组学可以帮助医生查明未诊断疾病的原因,帮助家属避免数年的医院就诊和不必要的检查。尽管世界各地对罕见病的定义各不相同,但每2000人中就有1人患有罕见病。1、2已知的罕见疾病有7000多种3.每年都有更多的发现。总人口的2-6%(1.5亿人)受到一种罕见疾病的影响。3、4、5

平均来说,寻找罕见疾病诊断的漫长过程——“诊断奥德赛”——需要5到7年,68医生,72到3个误诊。7鉴于80%的罕见病是遗传的或具有遗传成分,全面的基因组测序增加了发现患者潜在病因的潜力。8下一代测序(NGS)提供了罕见疾病诊断的最高可能性9、10也是结束诊断漫长旅程的最快途径。9

罕见病基因组学的未来就在眼前

yobet亚洲了解如何使用全基因组测序来寻找诊断,并在结束诊断奥德赛中带来新的理解水平。

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基因组学在罕见病诊断中的价值

基因组学正在推动罕见病诊断的根本性转变,从症状分析到分子病因学评估。了解疾病的生物学基础可以带来更好的护理和有针对性的治疗,产生可预测的、循证的结果。这种罕见病基因组学中的分子诊断是精准医学的基础。

罕见病的分子诊断是一个关键步骤,可以使患者、其家属、医生和其他医护人员受益。根据美国遗传与基因组学学院(ACMG)的说法,确定个人疾病的遗传病因对患者、他们的家庭和整个社会都是有用的。11

每一个诊断问题

基因组学在罕见病诊断方面的力量为世界各地的人们带来了新的希望。

读文章

罕见病基因组学的好处

定制的疾病管理

了解罕见病的发病机制可以让医生将患者转诊给合适的专家,选择量身定制的治疗方法,并提供针对特定疾病的随访。

减少费用

通过避免漫长的诊断过程,罕见病的基因组诊断可以帮助避免昂贵的检测和程序,并限制不必要的转诊。

生殖咨询

确定一种罕见疾病的遗传模式可以告知患者及其直系亲属和大家庭的复发风险,支持知情的计划生育。

社会心理的好处

除了避免与诊断长途跋涉相关的压力之外,接受分子诊断还将受影响的家庭聚集在罕见病支持小组的社区中。

社会福利

了解罕见病的基因组学可以帮助确定新的药物靶点和提高护理效率。

罕见病患者的故事

结束卡森蔡斯公司6年的诊断奥德赛

卡森最初被诊断为脑瘫,但他的弟弟蔡斯证明这是误诊。又过了四年,全基因组测序帮助明确诊断Carson和Chase患有线粒体烯醇基辅酶a还原酶蛋白相关神经退行性变(MEPAN)。

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多诺万的诊断

多诺万的症状清单引发了20多种不同疾病的怀疑,与近12种医学专业相吻合。6年后,全基因组测序发现了一种变异滑雪基因,多诺万被诊断为shprinzen - goldberg综合征。

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罕见病诊断的基因组方法

罕见病全基因组测序

全基因组测序是罕见病检测最全面的方法。它检查整个基因组,并有能力评估基因组编码和非编码区域的变异。第12 -

罕见病的全外显子组测序

全外显子组测序评估外显子,基因组的编码区域,与疾病相关的变异。9, 10年,20年

罕见病的靶向测序

靶向测序分析与罕见疾病或罕见疾病家族相关的特定基因。

染色体微阵列

染色体微阵列(CMA)技术可以识别基因组中较大的染色体变异和特定的、描述良好的变异。

比较基因组方法在罕见病诊断中的应用

诊断率是最常用于比较罕见疾病基因组检测方法的统计数据。这是指一项检测提供建立分子诊断所需信息的可能性。根据被研究的患者群体和纳入标准,诊断率可能有显著差异。

全基因组测序

在大多数研究中,全基因组测序(WGS)是所有方法中诊断率最高的。它广泛覆盖了基因组(> 97%),并能够检测多种变异类型(单核苷酸变异、内链变异、结构变异、拷贝数变异、重复扩增、线粒体变异和谬误)。第12 -

Whole-Exome测序

全外显子组测序(WES)是第二高的诊断率。与WGS相比,WES的基因组覆盖率更低(约占基因组的1.5%),检测到的变异类型更少。然而,WES比WGS更便宜,而且通常有更高的偿还率。9, 10年,20年

有针对性的测序

罕见病的靶向测序评估特定基因。最大的面板覆盖了不到0.5%的基因组。

染色体微阵列

染色体微阵列方法覆盖不到0.01%的基因组。CMA特别关注具有良好特征的致病变异的基因组区域。CMA的诊断率明显低于WES和WGS。9

发表的方法比较

基因组和外显子组测序和染色体微阵列在疑似遗传疾病儿童中的诊断和临床应用的荟萃分析

作者收集了37项不同研究的数据和结果,包括20068名儿童,以比较WGS、WES和CMA的表现。

观点发表
遗传诊断对既往未确诊疾病患者的影响

未确诊疾病网络由美国国立卫生研究院资助,用于评估最具挑战性的病例。本文作者比较了利用WGS和WES辅助罕见病诊断的经验。

观点发表
在线课程:罕见病的临床测序

本课程提供了儿科罕见病的概述,可用的检测选择,和基因组测序的临床实施。它可能与实验室提供者、医疗保健提供者、医疗保健组织和其他对罕见病人群基因组学综述感兴趣的人有关。这门课程是通过Illumina的教育资助才得以实现的。

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罕见疾病基因组学专题新闻

罕见病患者的研究进展

蓝十字蓝盾协会技术评审组织Evidence Street®发布了一份支持全基因组测序的积极评价。

项目熊宝宝

该试点项目通过快速查明罕见疾病的病因,为重症监护中的婴儿提供服务,为婴儿和家庭带来希望。

疑似罕见病新生儿临床试验

NICUSeq是一项多中心研究,评估全基因组测序是否能改变急性新生儿的临床护理。

捐赠WGS帮助寻找答案

iHope网络致力于结束长达数年的诊断过程,为那些面临罕见和未确诊疾病的儿童找到治疗方法。第一篇发表的iHope论文证明全基因组测序的诊断率为68.3%。

亚博官网人口

精准基因组学对罕见病的影响

逃离地狱之地

在这期播客中,澳大利亚无名综合征(SWAN)的Heather Renton讨论了她女儿的罕见疾病、诊断的艰难历程和NGS的影响。

来自Illumina的希望讯息

COVID-19给面临罕见疾病的家庭带来了额外的挑战。我们认识到罕见病界的这一负担,并继续致力于结束诊断的奥德赛。

一位母亲寻求诊断

树宝小时候患有高氧血症。全基因组测序在他的两个拷贝中都发现了一个变异PDHX基因,导致了量身定制的治疗。他几乎立刻就有了进步。

参考文献
  1. NIH遗传和罕见病信息中心(GARD)罕见病常见问题解答.2020年3月27日访问。
  2. 欧洲委员会公共卫生指导小组.2020年3月27日访问。
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  4. Ferreira CR.罕见疾病的负担。中华医学杂志2019;179(6):885-892。doi: 10.1002 / ajmg.a.61124
  5. Walker CE, Mahede T, Davis G,等。罕见疾病对西澳大利亚州的集体影响:基于人口队列的估计。麝猫医学。2017;19(5):546 - 552。doi: 10.1038 / gim.2016.143
  6. 结束罕见疾病儿童诊断困境全球委员会.2019.
  7. 罕见病影响报告:来自患者和医学界的见解。globalgenes.org/wp - content/uploads/2013/04/shirereport - 1. - pdf
  8. Bick D, Jones M, Taylor SL, Taft RJ, Belmont J.罕见、未诊断或遗传疾病的婴儿和儿童基因组测序的案例。中华医学与流行病学杂志2019;56(12):783-791。doi: 10.1136 / jmedgenet - 2019 - 106111。
  9. 克拉克MM,斯塔克Z,法奈斯L,等。基因组和外显子组测序和染色体微阵列在疑似遗传病儿童中的诊断和临床应用的meta分析NPJ Genom Med 2018;3:16。https://doi.org/10.1038/s41525-018-0053-8
  10. Vissers LE, Gilissen C, Veltman JA。智力障碍及相关疾病的遗传学研究。中国生物医学工程学报2016;17(1):9-18。doi: 10.1038 / nrg3999
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  12. Lionel AC, Costain G, monfare N,等。与靶向基因测序面板相比,改进的诊断率表明全基因组测序作为第一级基因检测的作用。麝猫医学。2018;20(4):435 - 443。doi: 10.1038 / gim.2017.119
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  20. Srivastava S, Love-Nichols JA, Dies KA等。荟萃分析和多学科共识声明:外显子组测序是神经发育障碍个体的一级临床诊断测试。麝猫医学。2019;21(11):2413 - 2421。doi: 10.1038 / s41436 - 019 - 0554 - 6