人体微生物组分析简介
人体微生物组分析是对人体内外微生物群落的研究。人类微生物组研究的目标是了解微生物在健康和疾病中的作用。
传统上，对人类皮肤、粪便或血液样本的研究依赖于时间和劳动密集型微生物学技术，即生长和分离单个生物体，然后进行表型或基因型分析。这些方法不可能在单个样本中进行微生物群落分析。
用于研究人类微生物组的下一代测序
NGS的吞吐量和成本节约推动了宏基因组学研究，该研究能够调查整个群落的基因组，包括那些无法培养的生物体的基因组。
用于分析人体微生物组的实验NGS方法包括:
鸟枪宏基因组测序
- 一种DNA测序方法，能对给定的复杂微生物样本中所有生物体的所有基因进行全面取样。
16 s rRNA测序
- 一种16S核糖体RNA基因测序方法，用于鉴定和比较给定样本中存在的细菌。
微生物metatranscriptomics
- 分析复杂样本中由一组微生物编码的所有RNA。
我们饮食的多样性
在过去几十年中，复杂疾病急剧增加。其中许多与微生物组组成异常有关，但因果关系仍有待了解。为了解决这个重要的问题，2016年9月16日，内布拉斯加大学宣布了一项具有远见的倡议，通过新的内布拉斯加州食品健康中心（NFHC）改变人们体验食物、农业和医药的方式。
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工具书类
- 人类微生物组学联盟（2012）《人类微生物组学研究框架》自然48:215-221。
- 秦杰，李勇，蔡Z，李S，朱杰等。（2012）肠道微生物群与2型糖尿病的元基因组关联。《自然》490:55-60。
- Maurice CF, Haiser HJ, Turnbaugh PJ。(2013)外源性药物塑造了活跃的人体肠道微生物组的生理和基因表达。细胞152:39-50。
- Karlsson FH，Tremaroli V，Nookaw I，Bergstrӧm G，Behre CJ，等。（2013）正常、受损和糖尿病血糖控制的欧洲妇女的肠道元基因组。《自然》498:99–103。
- 彭德斯J，斯托伯林H EE，萨维尔库尔PH，沃尔夫斯PE.（2013）作为抗药性蓄水池的人类微生物群。前微生物群4:87。