识别和跟踪传染病威胁
用NGS进行基因组监测可以跟踪传染病传播，并识别冠状病毒的新毒株和其他新出现的病原体。利用病原体基因组的近全序列数据，我们可以实施有效的传染病监测策略，防止进一步的传播和感染。
利用下一代测序技术(NGS)监测传染病可以:
- 跟踪全球传染病的传播途径
- 确定冠状病毒等病原体在传播过程中变异的速度
- 识别新型和已知的病原体突变，如冠状病毒、流感A和B等
- 研究传染病治疗抵抗力
- 研究疫苗逃避机制
基因组监测有助于公共卫生官员追踪流行病的路径，进行接触追踪，确定病原体进化的速度，并了解病原体是否正在以可能影响诊断或治疗效果的方式发生变化。
检测和鉴定冠状病毒突变
NGS是COVID-19等传染病基因组监测的一项有价值的技术。NGS不仅可以追踪冠状病毒突变株的流行情况，还可以识别新型冠状病毒突变，这与PCR技术不同。利用NGS，科学家可以检测低频少数变异、多重多态性和新突变。
随着冠状病毒变异，出现了新的毒株，如B.1.1.7(英国)、B.1.351(非洲南部)和B.1。426(加州)。监测和监测至关重要，因为突变可导致更大的传染性或传染性。这些冠状病毒突变可能会降低疫苗的有效性/保护性，甚至逃避检测诊断。
用NGS进行全基因组菌株分型可以帮助流行病学家快速识别和描述突变，以防止进一步传播。菌株级追踪可支持识别暴发聚集群和传播途径。
相比之下，PCR用于检测病原体基因组的特定区域;它不会在快速进化的病原体基因组中识别新的突变。此外，如果引物或探针结合区域发生突变，则PCR性能会受到影响。
COVID-19:新变种的含义
从52:31分开始，感染和冠状病毒突变的影响方面的权威邱立明(Charles Chiu)博士讨论病毒变异。其中包括在英国引起流感激增的B.1.1.7菌株;和B.1.351，首次在南非报道，其中的改变可能影响现有疫苗的有效性。
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测序
数据分析
DRAGEN covid - seq检测管道(RUO)
Dragen Covidseq测试应用程序（RUO）
Dragen Covid Lineage应用程序（Ruo）
特色产品
NovaSeq试剂盒
NovaSeq 6000系统的试剂套件为集群生成和SBS提供了现成的基于卡式的试剂。
NextSeq 550系统
灵活的NextSeq 550系统提供了高通量测序和阵列扫描之间的无缝过渡。
NextSeq 2000
突破性的台式测序仪允许您在各种当前和新兴的应用中探索新的科学，具有更高的效率和更少的限制。
预防下一次大流行
据估计，多达75%的新发或正在出现的传染病有动物源性。1，2我们现在知道，动物宿主在病原体传播中起着重要作用。有了NGS，就有可能筛选蝙蝠等水库动物，以预测和防止病毒病原体的爆发。
利用基于ngs的目标富集或宏基因组学进行传染病监测，可以帮助我们了解物种间的传播，人畜共患疾病如何出现、传播和对常见疗法产生抗药性，并使我们能够更好地控制、治疗和预防疾病爆发。
靶向的富集测序可以缩放以监测群体病原体，而Metagenomics的基因组监测允许无偏，无界面的培养检测和鉴定广泛的病原体。Metagenomics还有助于我们了解我们的微生物组和病原体相互作用之间的关系，这在设计措施控制传染病时是重要的。
yobet亚洲亚博官网人口了解更多:
目标浓缩宏基因组测序
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食品监督
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病毒监测
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呼吸道感染监测
这些面板为呼吸病原体和呼吸道病毒检测和表征提供靶向富集测序溶液，包括Covid-19和流感。
监测患动物传染病的水塘
散弹枪宏基因组学可以对人畜共患样本中完整的微生物群落进行DNA测序，包括新物种和已知物种。测序可用于了解AMR基因的出现、进化、传播和/或物种分布。
Healthcare-Acquired感染监测
基于ngs的细菌基因组测序与用户友好的bioMérieux软件配对，允许全面的分离物鉴别和鉴定。
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coronavirus软件
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COVID-19宿主风险与免疫反应
询问宿主遗传变异的方法和剖面驱动免疫应答的分子机制。
参考文献
- Woolhouse ME, gotage - sequeria S。寄主范围以及新发和再发病原体．emg Infect Dis. 2005; 11:1842-7。10.3201 / eid1112.050997
- Jones KE, Patel NG, Levy MA, Storeygard A, Balk D, Gittleman JL等。新出现传染病的全球趋势．自然。2008; 451：990-3。