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COVID-19宿主遗传与免疫反应图谱

冠状病毒

调查Covid-19宿主遗传学

揭开与Covid-19宿主敏感性相关的潜在的遗传因子和概念个体免疫系统反应可能有助于解开疾病的复杂性并揭示未来的治疗目标。鉴定与Covid-19疾病严重程度相关的遗传变异性是至关重要的,并研究免疫反应差异如炎症细胞因子,T细胞和NK细胞基因表达签名。下一代测序(NGS)和微阵列技术可以帮助研究人员询问宿主遗传变异,并表征驱动免疫应答的分子机制。

使用Illumina NGS和阵列技术研究宿主风险和免疫反应的主要好处包括:

  • 筛选不同样本集的可扩展性和灵活性,具有高吞吐量和低吞吐量选项
  • 解决方案,允许多组学方法分析宿主遗传变异和档案免疫转录和表观遗传签名
  • 数据分析和解释解决方案,以配合您的项目规模

宿主遗传学和免疫反应谱研究的方法

应用 目标 推荐方法
宿主遗传学研究
  • 定义宿主遗传危险因素
  • 识别与预防严重COVID-19相关的变体
宿主免疫反应谱
  • 了解免疫反应的生物学/机制
  • 识别与疾病进展相关的免疫生物标志物
  • 细胞因子等免疫应答相关基因的表达谱
  • 研究免疫相关基因的表观遗传差异
微生物组和宿主反应
  • 微生物组在Covid患者中的研究效果
Illumina序列为英国Covid-19研究的基因组
来自重症患者的数据可能有助于我们理解易感性基因。对整个人类基因组进行测序,可能会识别出有助于解释为什么COVID-19大流行对某些人威胁生命,而对其他人则不然。
网络研讨会:COVID-19宿主遗传学行动

Mark Daly博士讨论了一项全球努力,确定宿主基因对COVID-19疾病易感性和严重程度的贡献。

查看网络研讨会

利用基因组学研究COVID-19宿主遗传变异

爱丁堡大学(University of Edinburgh)的李·墨菲(Lee Murphy)博士的核心实验室应用基因组方法研究SARS-CoV-2住院患者疾病进展和结果中的宿主遗传变异。该团队及其合作者对DNA样本进行基因分型和WGS,并对NextSeq 2000系统进行mRNA测序。

查看视频
Covid-19宿主遗传学和免疫反应研究的环境
BaseSpace相关引擎支持围绕重要的细胞信号和免疫系统通路、生物标志物和潜在的候选药物线索进行假设验证,以帮助解决COVID-19危机。

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