识别和比较复杂微生物组或环境中的微生物

NGS提供了一种无培养的方法来识别使用其他方法可能找不到的细菌或真菌

16S及其rRNA序列测定

16S测序和ITS核糖体RNA (rRNA)测序是常用的扩增子测序方法,用于识别和比较给定样品中存在的细菌或真菌。ITS和16S rRNA基因测序都是比较复杂微生物或环境中难以或不可能研究的样品系统发育和分类的成熟方法。

用iSeq 100系统进行16S rRNA测序

使用iSeq 100系统的16S宏基因组学工作流程,可以实现细菌种群调查的属级敏感性。

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微生物学方法指南

所有你需要的信息,从图书馆准备到最终的数据分析。为您的实验室的微生物应用选择最好的工具。

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微生物学方法指南

与毛细管测序或基于pcr的方法不同,下一代测序(NGS)是一种无需培养的方法,能够分析样品中的整个微生物群落。基于ngs的16S和ITS rRNA测序方法的另一个优势是,它们提供了一种成本效益高的技术,可以识别传统方法可能无法发现的菌株。此外,NGS还提供了在测序过程中结合多个样本的能力。

真菌测序与分类

利用ITS宏基因组学工作流程对不同样品类型的真菌进行属水平检测。

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微生物与宏基因组学研究综述

宏基因组学是发展最快的科学学科之一。本文重点介绍了将Illumina测序技术应用于宏基因组学研究的同行评审出版物。

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微生物与宏基因组学研究综述

16S和ITS测序研究故事

对一口微生物进行测序
对一口微生物进行测序

Saca la Lengua项目使用16S和18S rRNA测序来鉴定人类口腔中的细菌和真菌。

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eDNA测序为生物多样性提供了强有力的研究
eDNA测序为生物多样性提供了强有力的研究

Michael Bunce博士使用下一代测序和元编码方法来研究环境DNA (eDNA)。

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宏基因组学绘制海洋生物多样性地图
宏基因组学绘制生物多样性地图

一支史诗般的海洋探险队对全球的海水样本进行了排序,以调查海洋生态系统中的浮游生物多样性。

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环境DNA测序

dna测序是研究生物多样性和监测生态系统变化的一种新兴方法。对于某些样本类型,结合使用16S或ITS测序和其他方法可以帮助揭示生态样本的多样性。

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环境DNA测序

Illumina提供支持16S和ITS rRNA测序的产品,从文库准备到数据分析和解释。我们演示的工作流可以帮助您从实验中摆脱猜测。

点击查看每个工作流步骤的产品。

Nextera XT v2索引试剂盒

多路复用样本以提高样本吞吐量。

MiSeq系统

速度、准确性和简单性,可广泛应用于微生物学领域。

iSeq 100系统

可负担得起,快速和可获得的测序能力,在任何实验室的目标或小基因组测序。

MiSeq v3试剂盒

改进化学,增加簇密度和读取长度。600循环试剂盒是理想的16S rRNA测序。

MiSeq v2试剂盒

产生高达7.5 Gb的数据。500循环试剂盒允许16S rRNA测序多达1500万reads。

BaseSpace应用分类学分类

16 s宏基因组

使用绿基因分类数据库的Illumina管理版本对16S rRNA靶向扩增子读取进行分类。

海怪宏基因组学

利用k-mers精确比对和一种新的分类算法,以高灵敏度和高速度为短DNA序列分配分类标签。

它的宏基因组

使用UNITE分类数据库对真菌rRNA靶向扩增子进行分类分类。

MetaPhlAn

Metagenomic系统发育分析(metaphan)工具从Metagenomic霰弹枪测序数据分析微生物群落组成。

QIIME预处理

微生物生态学定量洞察(QIIME)旨在将用户从原始测序数据带到出版物质量图形和统计数据。

一个食品

通过快速、全面、准确的数据平台,从BaseSpace Sequence Hub快速评估您的样本,实现宏基因组分析。

16S rRNA测序协议
16S rRNA测序协议

查看演示的协议和16S rRNA扩增子测序的常见问题,以及与协议生成的库中的示例数据集,并在MiSeq系统上运行。

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ITS-rRNA测序协议
ITS-rRNA测序协议

查看用于分析真菌或宏基因组样本、引物序列和BaseSpace Sequence Hub分析工作流的演示协议。

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MiSeq, 16S rRNA测序和美国肠道项目
16S rRNA测序与“公民科学”

下一代测序使人类微生物组的研究成为可能,例如美国肠道项目。

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16S rRNA测序网络研讨会
16S rRNA测序网络研讨会

详细介绍我们演示的16S rRNA测序方案,包括数据可视化和成功案例。

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医院微生物组项目
医院微生物组项目

杰克·吉尔伯特博士讨论了医院获得性微生物感染的动力学。

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