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HLA测序

简化高精度HLA测序

HLA区域的测序可以为免疫紊乱提供关键的见解。用传统方法获得高分辨率人类白细胞抗原(HLA)分型结果需要多种分析方法、系统和分析程序。

HLA分型通过下一代测序(NGS)产生明确的、相解析的HLA分型结果,使用单一的分析方法、系统和分析程序。

HLA测序中的新范式
HLA测序中的新范式

在单一的测定中达到HLA中的高精度,效率和确定性。

有针对性的测序

基于NGS的HLA分析的好处

HLA区域是基因组最密集的多态性区域。由于HLA基因和假期引起的高水平序列同源性,密集的可变性和群体中数千个HLA等位基因的表征差异,常见地难以令人难以困难。

利用合成(SBS)化学进行Illumina测序的NGS克服了这些挑战,使简单、高质量的HLA关键基因分析成为可能。高准确度和高稳定性的Illumina测序合成(SBS)化学是世界上最成功和广泛采用的NGS技术

NGS在HLA分析中的应用

原则上,NGS类似于Sanger(毛细管电泳基)测序。当每个片段从DNA模板股线重新合成时,依次依次鉴定DNA片段的碱基。ngs缩放了这个过程;以大规模平行的方式发生数百万反应。该进展能够快速测序大型DNA,如HLA区域。

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相位分辨的HLA序列分析

Illumina NGS技术支持配对结束排序,这是一个对成功,明确的HLA打字至关重要的独特功能。测序库DNA片段的末端会产生高质量的基础呼叫。2读数之间的物理链路(来自来自相同的克隆扩增的库DNA片段)允许每个读对中发现的变体的关联。成对读取之间的距离因随机库片段生成过程而变化,允许直接分辨率为2个变体。

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特色HLA测序研究

肿瘤特异性HLA配体
使用肿瘤特异性HLA配体的精密免疫疗法

RNA-Seq和HLA分型提高了靶标发现平台的能力和效率。

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有针对性的DNA分析
HLA遗传学和自身免疫病

研究人员用NGS查询基因组,并进行HLA基因分型以识别免疫介导疾病的新风险位点。

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DNA测序
在巴西探索HLA多样性

利用巴西人的遗传多样性,研究人员开发了一个HLA变异数据库。

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多路复用的优点

多路复用使得在单个实验期间能够同时测序大量基因座。单个“条形码”序列被添加到每个基因座中,因此可以在HLA测序数据分析期间进行区分。

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样本到报告HLA键入

TruSight HLA v2测序面板在一个单一的检测方法中,通过一个单一的工作流程,在一个单一的仪器上,可以同时对数十个样本进行相解析、样品到报告的HLA分型。为每个位点的每个样本解决歧义的日子一去不复返了;TruSight HLA首次提供超高分辨率分型结果。

了解免疫学疾病

NGS和MicroArray解决方案使研究人员能够调查潜在的自身免疫疾病机制,免疫再胃,肿瘤免疫原性以及免疫相关遗传变异的功能后果。

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immuno-oncology研究
HLA样本报告

精选测序仪器

  • MiniSeq系统:对于低样本号即使对于低样品号而言,采用低购买价格和成本效率,MinieSQ也能够广泛的靶向DNA和RNA应用。
  • miseq系统:访问聚焦的应用,如靶向重试,偏心组合,小基因组测序,靶向基因表达分析等。
  • nextseq 550系统:一种高通量支本序列序列,使全基因组,转录组和有针对性的重构加上扫描选择微阵列的能力。

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特色资源

介绍Trusight HLA.
HLA打字的演变

TruSight的HLA测序解决方案提供了高效、经济、高质量的超高分辨率HLA分型。

通过合成测序illumina测序
通过合成测序illumina测序

Illumina SBS化学已彻底改变了基因组学的研究。见SBS化学在行动中。

TruSight HLA v2白皮书
白皮书:HLA测序

72国际组织合作工作组(IHWG)参考样品重复测序结果。

*文件上的数据计算。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版