HLA区域是基因组最密集的多态性区域。由于HLA基因和假期引起的高水平序列同源性,密集的可变性和群体中数千个HLA等位基因的表征差异,常见地难以令人难以困难。
利用合成(SBS)化学进行Illumina测序的NGS克服了这些挑战,使简单、高质量的HLA关键基因分析成为可能。高准确度和高稳定性的Illumina测序合成(SBS)化学是世界上最成功和广泛采用的NGS技术
原则上,NGS类似于Sanger(毛细管电泳基)测序。当每个片段从DNA模板股线重新合成时,依次依次鉴定DNA片段的碱基。ngs缩放了这个过程;以大规模平行的方式发生数百万反应。该进展能够快速测序大型DNA,如HLA区域。
Illumina NGS技术支持配对结束排序,这是一个对成功,明确的HLA打字至关重要的独特功能。测序库DNA片段的末端会产生高质量的基础呼叫。2读数之间的物理链路(来自来自相同的克隆扩增的库DNA片段)允许每个读对中发现的变体的关联。成对读取之间的距离因随机库片段生成过程而变化,允许直接分辨率为2个变体。
多路复用使得在单个实验期间能够同时测序大量基因座。单个“条形码”序列被添加到每个基因座中,因此可以在HLA测序数据分析期间进行区分。
这TruSight HLA v2测序面板在一个单一的检测方法中,通过一个单一的工作流程,在一个单一的仪器上,可以同时对数十个样本进行相解析、样品到报告的HLA分型。为每个位点的每个样本解决歧义的日子一去不复返了;TruSight HLA首次提供超高分辨率分型结果。
*文件上的数据计算。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版