HLA区域是基因组中最密集的多态区域。众所周知,由于HLA基因和假基因之间高度同源性、密集的变异性以及人群中数千个HLA等位基因的特性不佳,HLA基因的测序非常困难。
NGS与Illumina合成测序(SBS)化学克服了这些挑战,使简单、高质量的分析HLA关键基因。Illumina测序合成(SBS)化学是全球最成功和最广泛采用的NGS技术
原则上,NGS与Sanger(基于毛细管电泳的)测序相似。DNA片段的碱基由DNA模板链重新合成时发出的信号依次确定。NGS扩大了这一过程;数以百万计的反应以一种大规模的并行方式发生。这一进展使得快速测序大序列的DNA,如HLA区域。
Illumina NGS技术支持对端测序,这是成功、明确的HLA分型的关键特性。对文库DNA片段的末端进行测序可以产生高质量的碱基调用。两个reads之间的物理联系(源自同一个克隆扩增文库DNA片段)允许在每个reads对中发现的变体之间的联系。配对读取之间的距离随着随机库片段生成过程的结果而变化,允许直接解析2个变体的阶段。
的TruSight HLA v2测序面板在单一检测中,通过单一工作流程,在单一仪器上,对数十个样品同时进行11个位点的phase-resolved, sample-to-report HLA typing。为每个位点上的每个样本解决歧义的日子已经一去不复返了;TruSight HLA首次提供超高分辨率的分型结果。
*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版