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HLA测序

高精度HLA测序

对HLA区域进行测序可以对免疫紊乱提供重要的见解。用传统方法获得高分辨率的人类白细胞抗原(HLA)分型结果需要多种分析、系统和分析程序。

下一代测序的HLA分型(NGS)使用单一的分析、系统和分析程序产生明确的、相分辨的HLA分型结果。

HLA测序的新范式
HLA测序的新范式

在一次检测中实现高精度、高效率和确定性的HLA分型。

有针对性的测序

NGS-Based HLA分析的好处

HLA区域是基因组中最密集的多态区域。众所周知,由于HLA基因和假基因之间高度同源性、密集的变异性以及人群中数千个HLA等位基因的特性不佳,HLA基因的测序非常困难。

NGS与Illumina合成测序(SBS)化学克服了这些挑战,使简单、高质量的分析HLA关键基因。Illumina测序合成(SBS)化学是全球最成功和最广泛采用的NGS技术

NGS在HLA分析中的应用

原则上,NGS与Sanger(基于毛细管电泳的)测序相似。DNA片段的碱基由DNA模板链重新合成时发出的信号依次确定。NGS扩大了这一过程;数以百万计的反应以一种大规模的并行方式发生。这一进展使得快速测序大序列的DNA,如HLA区域。

yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于NGS技术

相分辨HLA序列分析

Illumina NGS技术支持对端测序,这是成功、明确的HLA分型的关键特性。对文库DNA片段的末端进行测序可以产生高质量的碱基调用。两个reads之间的物理联系(源自同一个克隆扩增文库DNA片段)允许在每个reads对中发现的变体之间的联系。配对读取之间的距离随着随机库片段生成过程的结果而变化,允许直接解析2个变体的阶段。

yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于配对端测序的信息

HLA测序研究

肿瘤特异性HLA配体
使用肿瘤特异性HLA配体的精确免疫疗法

RNA-Seq和HLA分型正在提高目标发现平台的能力和效率。

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有针对性的DNA分析
HLA遗传学与自身免疫疾病

研究人员用NGS对基因组进行查询,并进行HLA基因分型,以确定免疫介导疾病的新危险位点。

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DNA测序
在巴西探索HLA多样性

利用巴西人的遗传多样性,研究人员开发了一个HLA变异数据库。

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多路复用的优点

多路复用可以在一次实验中同时对大量的基因座进行测序。在每个位点上添加个体“条形码”序列,以便在HLA测序数据分析时进行区分。

yobet亚洲亚博官网人口了解关于多重排序的更多信息

Sample-to-Report HLA打字

TruSight HLA v2测序面板在单一检测中,通过单一工作流程,在单一仪器上,对数十个样品同时进行11个位点的phase-resolved, sample-to-report HLA typing。为每个位点上的每个样本解决歧义的日子已经一去不复返了;TruSight HLA首次提供超高分辨率的分型结果。

了解免疫疾病

NGS和微阵列解决方案使研究人员能够调查潜在的自身免疫疾病机制、免疫库、肿瘤免疫原性和免疫相关遗传变异的功能后果。

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immuno-oncology研究
HLA样本报告

特色测序仪器

  • MiniSeq系统MiniSeq具有低廉的购买价格和成本效益,即使样品数量较低,也能广泛应用于靶向DNA和RNA。
  • MiSeq系统:访问重点应用,如靶向重测序,宏基因组学,小基因组测序,靶向基因表达分析,等等。
  • NextSeq 550系统:高通量台式测序仪,可实现全基因组、转录组和靶向重测序,并具有扫描选择微阵列的能力。

参见所有台式定序器

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特色资源

引入TruSight HLA
HLA分型的进化

TruSight HLA测序解决方案提供了流线型、经济和高质量的超高分辨率HLA分型。

Illumina测序合成
Illumina测序合成

Illumina SBS化学已经彻底改变了基因组学的研究。参见SBS化学行动。

TruSight HLA v2白皮书
白皮书:HLA测序

72份国际组织相容性工作组(IHWG)参考样本重复测序结果

*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版