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微生物基因组学

芝加哥谢德水族馆研究微生物对海洋生物的影响

首先是一类项目,识别微生物社区以改善水生动物的健康

芝加哥谢德水族馆研究微生物对海洋生物的影响
2016年9月27日

任何生物都有DNA,无论是生活在陆地、空气还是水中的。我们采访了比尔·范伯恩,动物卫生副总裁,兽医局局长谢德水族馆来了解他们的微生物组项目。yobet亚洲在固安格基金会的支持下,并与阿贡国家实验室、伊利诺伊大学、伊利诺伊理工学院和美国农业部合作,这个创新项目正在使用IlluminaMiSeq系统来研究与水族馆动物共享环境的无数看不见的生物之间的独特关系。

微生物组项目的目标是什么?它是如何开始的?

我们的Microbiome项目旨在了解我们如何操纵环境栖息地,以创造对动物健康最佳的微生物社区。该项目诞生于多年的观察结果,强调了对管理环境对微生物社区的影响更好的需求。特别是,我们与鲸鱼,海豚和海豚等鲸类的工作导致我们怀疑(与人类健康一样)大量管理或消毒的环境可能不如一个更多样化的微生物组的益处。

MISEQ系统如何受益于您的研究?

谢德水族馆是一个公共展示设施,每年有超过200万的游客。我们的实验室有很大的窗户,展示MiSeq作为关键仪器,让参观者可以看到空间和了解我们的研究。yobet亚洲游客们通常会惊讶地得知,这项工作是由水族馆完成的,并对我们将能够yobet亚洲发现的下一代测序的潜力感到兴奋。

我们将我们的Missq“Horton”命名为Seuss角色博士,谁可以“听到”数百万微小但重要的生物,这是一旦看不见的。我们喜欢在实验室里有霍顿,因为他是发现我们的工作的令人兴奋的观点的象征。仪器的人身化似乎与所有年龄段的游客共鸣。

Miseq使我们可以在一次运行中从数百种样品中调查微生物社区。通过小团队和许多未解决的问题,易用性和能力从样本迅速移动到发现是至关重要的。

你从研究中学到了什么?yobet亚洲

在Shedd Aquarium,我们是一个“建造环境”,可重复32,000只动物的自然栖息地。我们也是芝加哥最受欢迎的文化吸引力。这些功能使我们的设施成为一种独特的地方,观察人类和动物的微生物是如何互动的,并以不可行的方式测试假设。

作为将游客与现实世界连接起来的使命的一部分,我们提供了各种各样的亲身体验,就像我们的Stingray触摸展览.作为季节性的户外栖息地,黄貂鱼触感在2015年夏天接待了超过43万名游客,让我们有了一个独特的机会来观察人类和牛鼻魟之间的相互作用。我们的研究发现,尽管随着季节的推移,魟鱼栖息地的微生物多样性有所增加,但我们世界级的兽医团队无法检测出动物健康结果的任何差异。事实上,与被藏在幕后的对照组射线相比,被探望的射线在考试期间心率更低。

您对海洋生物学和/或水族馆进行了研究的影响是什么?

通过A. Watson Armor III的Shedd Aquarium的动物健康和福利中心,我们致力于不断推进水生动物护理背后的科学。作为第一个描述我们环境的微生物生态学的水族馆,我们希望成为动物园和水族馆社区内的资源。我们希望我们的调查结果能够帮助我们更好地照顾水生生活,不仅在动物园,而且在河流,湖泊和海洋中。

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