2021年7月27日
“上个月,我们有最大的峰值(积极COVID病例)大流行以来,”艾德里安博士说亚历杭德罗Ceballos洛佩兹,医学主任Biomedicos de梅里达。Biomedicos是唯一实验室采用了测序在墨西哥南部的临床应用,一个区域的特点是极端的经济差距。但直到新的Illumina公司COVIDSeq™试验本月推出,他们还没有测序SARS-CoV-2病毒。Biomedicos是世界上第一个客户使用96 -样本化验。在几天内收到装备,他们有21个样本测序,发现15γ和三个α变体。
在尤卡坦半岛,有一个相当大的退休人口的侨民从美国和加拿大,以及游客梅里达和附近的坎昆。Ceballos洛佩兹想知道游客可能会引进变异。“我觉得有很大概率α或δ变体。现在在墨西哥没有强制性COVID测试进入美国。它仍然是强制戴上面具。“既然他可以SARS-CoV-2序列,他将能够识别源。
“我们的老年人口已经收到完整的疫苗接种,但是人们年龄在40到60只收到第一剂量。我们需要排序,因为我们正在观察一个容易传播病毒和年轻患者更严重的疾病。”
Biomedicos渴望推出测序检测SARS-CoV-2在他们的地区。实验室服务的墨西哥东南部,包括尤卡坦半岛,恰帕斯,塔巴斯科辣酱油,坎佩切,金塔纳罗奥州。实验室还提供了服务,伯利兹的邻国。
在购买一个Illumina公司MiSeq™在2020年末Hematology-Oncology, Ceballos洛佩兹是使用新的兴奋COVIDSeq™试验,它允许小型实验室参与监督。COVIDSeq分析工具包提供试剂准备96样品的测序MiSeq™, MiniSeq™,和iSeq™100系统,另一个更易于管理的3072个样本NovaSeq™6000甚至384样品NextSeq™500/550/550Dx / 2000。
“我们将能够识别临床意义的变异,也许一个新的,“Ceballos洛佩兹说。
今天,有超过1.91亿COVID-19病例世界各地的报道。许多国家正在测序阳性病例和报告变异来支持公共卫生管理。但大多数现有的基因组数据来自大型基因组中心实验室有能力进行高通量样品处理,和国家有限的资源投资于高通量测序低提交COVID监测网络。
COVIDSeq试验提供低收入和mid-throughput实验室访问分散式监测在较小的范围内,将序列和识别病毒变异,可以帮助公共卫生机构管理COVID-19大流行。增加监测检测新兴和普遍的变体是至关重要的全球努力控制病毒。
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