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Illumina收购Enancio的压缩软件

减少基因组数据存储和传输成本与数据泛滥

Illumina收购Enancio的压缩软件
2020年7月14日

2019年,Illumina全球安装的15000多个测序系统生成的基因组数据量同比增长了50%以上,达到150个petabase。这相当于连续录制了500年的高清视频。这一庞大的数据是测序成功的故事,突出了测序成本降低的影响,以及基于测序的研究和临床应用的激增,这些研究和应用可能有助于影响生命的结果。

Illumina致力于提供最创新和最灵活的测序技术是众所周知的。也许人们不太了解,该公司同样致力于帮助客户管理日益增长的数据输出,以减少成本和时间来了解基因组。

继2018年5月收购Edico和2020年6月收购云软件公司BlueBee之后,Illumina非常高兴地欢迎位于法国Cesson-Sévigné的基因组压缩软件公司Enancio。Enancio的无损压缩技术通过将Illumina测序仪的输出从50GB压缩到10GB,将数据存储成本降低了5倍。一旦接入,Enancio的技术将直接集成到DRAGEN,以及我们的云存储平台服务。

Illumina产品开发高级副总裁Susan Tousi表示:“Illumina继续系统地解决我们测序系统用户产生的大量数据所固有的数据瓶颈,因此,我们很高兴欢迎Enancio加入Illumina家族。”“Illumina现在有一个行业领先和差异化的二级分析工具DRAGEN,一个可扩展的云数据交换平台,Illumina分析平台(IAP)和BlueBee技术,这为我们的客户培育了一个成本有效、快速和简单的工作流程。有了Enancio和BlueBee的加入,Illumina现在可以提供卓越的数据云服务。”

这一信息海啸既深远又复杂,但在数据中蕴藏着巨大的科学进步的无限可能,与DRAGEN一起,我们将使存储和传输数据更有效和用户友好

Enancio的预商用云压缩技术降低了数据存储成本,同时保持了数据的完整性。Enancio的压缩是一种无损的、基于参考的基因组数据压缩器。DNA序列是使用基于参考的方法压缩的:reads是使用一个特别为压缩而设计的超快映射方案映射到参考基因组上的。一种紧凑的二进制格式用于将读取编码为位置和差异列表,然后是熵编码器。质量分数使用范围编码器和适应不同类型质量方案的上下文模型以无损的方式进行编码。

Enancio的技术为基因组数据的压缩和解压提供了最佳的速度和效率水平,很好地补充了Illumina的其他信息学解决方案。

Enancio首席执行官Jennifer Del Giudice表示:“我很荣幸加入Illumina,我们将共同应对将研究人员和临床医生推向数字时代的数据海啸。”“这一信息海啸既深远又复杂,但在数据中蕴藏着伟大科学进步的无限可能,与DRAGEN一起,我们将使数据的存储和传输更加高效和友好。”

Illumina最近的基因组分析相关收购打破了数据洪流中固有的障碍。我们致力于改善整个端到端的基因组测序工作流程的客户体验,稳健和创新的信息学发挥着关键作用。Illumina继续推动基因组数据的利用,并加速在临床护理中采用基因组数据。

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