2020年10月12日
在任何地区出现的危险新的病原体是毁灭性的，但甚至更有程度地，当基因组和生物信息学基础设施不足以识别，监测或慢速蔓延。在资源限制环境中，公共卫生官员努力分配诊断或疫苗等珍贵医疗商品。亚博下载app非洲需要实时信息，高保真。病原体基因组的下一代测序（NGS）可以提供这些见解，减轻潜在的生命丧失。
虽然基因组测序数据已被用于开发测试、疫苗和治疗方法，以及监测病毒突变，但由于设备的前期费用高、训练有素的实验室人员短缺、数据分析基础设施很少、以及相互竞争的公共卫生优先事项给财政能力带来了压力。
NGS提供准确，有效，更便宜的方式来迅速序列序列大量基因组，能够追踪可能导致人口中疾病爆发的病原体，这是一种称为监视的方法。NGS还可以跟踪影响疾病对策，例如诊断，治疗和疫苗等遗传变化。亚博下载app
在非洲大陆实现遗传测序和疾病爆发监视能力，艾伦娜很自豪地支持非洲病原体基因组学倡议。
今年春天，只有少数非洲机构对SARS-CoV-2阳性样本进行了测序，以确定传播毒株的特征。作为在低收入和中等收入地区实现基因组能力的持续承诺的一部分，Illumina捐赠了价值140万美元的测序系统和相关消耗品通过非洲联盟和非洲疾病控制和预防中心(Africa CDC)向非洲成员国提供援助。
现在，Illumina正在加入一个跨部门伙伴关系，以支持非洲疾控中心病原体基因组学研究所启动非洲病原体基因组学计划(Africa PGI)。该全面行动计划将扩大对国家地理信息系统工具和专门知识的获取，目的是加强整个非洲大陆的病原体能力，包括在20多个国家进行能力建设。Illumina将在4年内捐赠价值约2000万美元的NGS平台、试剂和培训支持。这项耗资1亿美元的计划的合作伙伴包括美国疾病控制和预防中心、比尔和梅林达·盖茨基金会、牛津纳米孔技术公司、微软等。
Illumina首席医疗官Phil Febbo说:“在实现整个非洲大陆的基因测序和疾病暴发监测能力方面，Illumina很自豪地支持非洲病原体基因组计划。”“在我们与合作伙伴合作加强公共卫生威胁的科学基础的同时，国家地理信息系统在疫情的所有阶段——从初步描述到病原体监测、疫情管理和大流行后监测——发挥着关键作用。我很高兴Illumina参与了这个全面的项目，不仅将提供NGS技术，还将提供培训项目、数据基础设施和长期可持续发展所需的政府支持。”
这项新举措将促进和支持针对COVID-19和其他疾病威胁的基本研究和公共卫生应对措施，包括艾滋病毒/艾滋病、结核病、疟疾、霍乱和其他传染病等地方病。掌握来自整个非洲大陆的这些病原体的基因组信息，对于当前抗击抗菌素耐药性的努力至关重要，抗菌素耐药性可能是全球最大的公共卫生威胁。该倡议的目的不仅是加快实施用于病原体监测的国家地理信息系统，而且还旨在推动可持续性，以确保能力得到维持。该实验室网络——其中一些首次获得了NGS能力——将对非洲疾控中心于2019年启动的病原体基因组学研究所起到补充作用，以加强整个非洲的病原体基因组学和生物信息学能力。
除了物理实验室网络之外，还将创建一个病原体基因组学培训项目，即NGS学院，为公共卫生机构提供培训和工具，为公共卫生行动和研究人员生成和翻译基因组学数据。这将使他们能够参与并领导传染病基因组学方面的国际合作。
在Illumina，我们相信，与研究和资源的合作将取得最大的成果。这笔捐赠是我们企业社会责任计划的一部分，是我们致力于加速基因组学的获取，并对人类产生积极影响的一种表达——不仅通过我们的技术，还通过我们的行动。
有关非洲病原体基因组学倡议的更多信息，点击这里。
照片:Adeyinka Yusuf / iStock
