2015年8月24日
下一代测序（NGS）和基因分型技术正在彻底改变动物育种。传统的动物育种依赖于基于其观察到的物理特征（表型）来评分动物以确定其估计的育种值（EBV）。该过程往往效率效率低，并且只有在动物达到成熟后，许多特征才难以评估和显而易见，导致验证育种结果的延迟。
现在，NGS使研究人员能够快速和成本有效地序列牲畜基因组以发现相关的DNA变体。旨在测量这种方差的基因分型阵列可以用于开发比传统EBV更快，更准确的基因组育种值（GBV）。
最近，爱尔兰养牛联合会(ICBF)选择Illumina作为其牛肉数据和基因组项目的技术合作伙伴。ICBF是一家负责为爱尔兰奶制品和牛肉行业提供养牛信息服务的非营利组织。该计划将从2015年持续到2020年，将提高全国畜群的总体优势。
参与的农民将被要求通过向ICBF提交样本，对其15%的奶牛进行基因型化。ICBF的目标是在2017年项目中点之前对100万头牛进行基因型化，并预计在整个项目过程中对超过200万头牛进行基因型化。
牛肉数据和基因组学计划将有两个主要优势。一个是对农民的盈利能力，这对于爱尔兰的更大善，农业是经济的重要组成部分。其次，由于奶牛生产甲烷（损坏的温室气体），对爱尔兰国家群体的更有效的管理应该具有积极的环境影响。
“这是农业基因组学向前迈出的里程碑式的一步。Illumina公司农业基因组学市场开发经理Iain MacLaren-Lee说:“Illumina公司很高兴成为世界上第一个对100万只动物进行基因型化的项目的一部分。”“到目前为止，在单个项目中已经完成了数万个，甚至是几十万个样本。100万真的正在向全国范围发展。”
Illumina正在帮助ICBF设计一个完全定制的SNP阵列来测试这些动物。该项目将使用Infinium阵列和NGS的组合。DNA变异将使用NGS识别，并使用Infinium Beadchip技术用于筛查大规模人群。
麦克拉伦-李补充说:“最终的目标是使每一个出生的动物都能被基因分型。在爱尔兰，这将是每年200万只动物。ICBF和爱尔兰农业部的目标是成为世界上第一个对整个国家畜群进行基因分型的国家。这个100万样本项目是农业中国家规模基因组学道路上的一个重要里程碑，也是基因分型在畜牧业中的常规采用。”
