2015年11月19日
玉米或玉米是世界经济的重要作物，这不仅是人类的食物，还为乙醇燃料和牲畜饲料的组成部分。根据USDA数据2013年和2014年，这是任何U.S.种植的作物中最大的（在收获的AGRES方面）。作为具有高遗传多样性水平的作物，玉米使育种者能够支持种子优化的种子（气候，土壤等）。
为了帮助审查玉米遗传变异，Illumina发射了Maizenp50珠芯片在2010年，并给予研究人员和种子公司在玉米基因组上询问超过55,000种变体的力量。尽管提供了这种稳健的产品，种子公司和公共育种计划需要更多策划关于玉米遗传学的策划信息，因为他们需要能够分析大型样本卷来优化育种努力。与此同时，国际种子界最近一致一定用于确定基本衍生的品种（EDV）地位（这对于建立种子的知识产权很重要）。Mike Thompson，导演，市场开发，农业基因组学，告诉我们新的Illumina如何Maizeld Beadchip.将解决这两种需求。
为什么有注册新品种的玉米新标准？
尽管存在差异，但植物的基本衍生的品种（EDV）是源自初始品种的并保留该品种的基本特征。EDV测试可用于平衡初始品种育种者的知识产权与随后的育种者使用初始品种开发新品种。它是一种措施，有助于整体理解新作物品种，因为它可以用来证明新品种具有显着的改善，而不仅仅是与初始品种的化妆品差异。在某种程度上，通过该过程赋予植物品种保护类似于保护专利的权利要求。
从历史上看，简单的序列重复（SSRS）是建立EDV和初始品种之间关系的基础。但是，通过新技术，种子群落确定单核苷酸多态性（SNP）是EDV测试的更好标记。由于它们的高丰度和更高的密度图分辨率，较高的吞吐量，更低的成本，更低的错误率以及它们在实验室的普遍使用，因此它们已经大大用SNPS取代了SSRS。
什么是maizeld beadchip，它是如何发展的？
Maizeld Beadchip是24样品格式的Infinium阵列。该芯片包括3,072个标记，并使客户有机会添加额外的自定义内容，最多90,000个标记。珠芯片中包含的标记是信息性SNP，其在玉米基因组上间隔开。[1]
通过使用MaizeNP50 Beadchip测试来自美国和欧洲的玉米线来鉴定珠芯片上的内容。通过美国种子贸易协会（ASTA）和法国育种者协会（UFS）之间的五年合作，通过国际种子联合会（ISF）的支持，珠芯片上的3,072个标记被同意向SSRS提供等效。
超越EDV测试，如何使用Maizeld Beadchip？
育种者（公共和私人）对预测种子的未来表现有很大的兴趣。遗传分析的现有工具，如麦格纳普50珠芯片，已经证明了预测性能的基因组方法是有效的。Maizeld Beadchip将内容聚焦到MaizeNP50 Beadchip中的内容用作有效的基础阵列，具有跨越广泛的玉米品种。许多繁殖计划将利用该产品的灵活性添加自定义内容，为其具体的品种和地理需求补充基础阵列。它对育种者来说是一种经济型工具，用于检查整个基因组的信息性变异，并导出将加速育种计划的基因组育种值。
[1]玉米基本衍生研究：III。欧洲和北美种质中单核苷酸多态性基因座的选择与评价。作物科学，2015;55（3）：1170-80。
