6月13日
今年7月，斯德哥尔摩将举办第三届地铁和城市生物群落元基因组学和元设计(MetaSUB)年会，将汇集致力于绘制全球超过67个城市的城市宏基因组的研究人员。
这个雄心勃勃的项目始于两年前，当时克里斯托弗·梅森教授和他的团队他为纽约市创建了第一个基于地表的、城市规模的微生物组和宏基因组研究。利用DNA数据，该项目研究了这种“城市微生物群”如何随着天气、清洁程度、建筑材料甚至社区社会经济水平等变量而变化。该团队试图建立整个地铁系统的基线概况，识别潜在的生物威胁，并提供额外级别的数据，供城市使用，以创建“智能城市”，即使用数据来改善城市规划、管理和人类健康。值得注意的是，近一半(48%)的DNA测序与已知的生物体不匹配，这突出了每天环绕在乘客周围的巨大微生物群。
纽约地铁项目只是一个开始，导致了一个国际实验室联盟的创建，以建立一个全球性的公共交通系统微生物群落的“DNA地图”，Illumina是该项目的工业合作伙伴。
我们采访了来自斯德哥尔摩大学的Klas Udekwu，他正在瑞典领导研究Illumina的下一代测序如何使这项研究成为可能，并听取了他如何将项目范围扩大到非洲尼日利亚的雄心壮志。
