在农业和环境基因组测序
世界各地的研究人员使用的是植物和动物研究不同物种的基因组测序。发现这些基因地图提供了丰富的基础,帮助我们理解生活和演化和找到新的方法保护濒危物种。
利用新一代测序(上天)在农业也将允许更有效率和可持续发展实践,这样在一起,我们可以满足不断变化的环境的挑战和养活不断增长的人口的需求。
农业基因组测序的方法
| 方法 | 描述 | 使用 |
|---|---|---|
| 新创测序 | 新创植物或动物测序是第一步了解生物体的遗传基础的特征和与环境的相互作用。 | 分配地图位置和堆栈品种信息,后续重测序发现单核苷酸多态性(snp)和其他基因变异。 |
| 全基因组重测序 | 综合分析整个基因组的方法,当一个物种的基因组参考。 | 识别基因单核苷酸多态性,和结构变异,同时确定基因型。 |
| 转录组测序 | 核糖核酸测序提供了新颖的见解改变基因表达水平发生在开发和在疾病和压力条件。 | 阐明基因和蛋白质功能和交互,识别组织RNA转录的列表,并发现新的单核苷酸多态性。 |
| 表观遗传学 | 自适应响应环境的变化(如食物可用性或干旱)可以引发植物和动物的表型变化,影响其生存和生殖健康。 | 通过测序识别DNA甲基化的变化,染色质结构,和小RNA的表达,你可以更好地了解表观遗传因素控制这些和其他特征的一种兴趣。 |
| 有针对性的重新排序 | 这种方法序列的遗传变异在许多领域样本。 | 识别常见和罕见variants-such SNPs和拷贝数变异(CNVs)——帮助繁殖决策或描述疾病的易感性。 |
| 基因分型结果进行排序 | 低成本的遗传筛查方法发现新的植物和动物snp基因分型结果和执行研究,经常在很多标本同时进行。 | 应用包括基因映射,筛选回交线,纯度测试,构建单体型地图,和表演协会为植物基因组研究和基因评价。 |
| 环境DNA测序 | 一个有效的生物监测工具,允许表征水生细菌和真核物种的土壤和其他样品。 | 应用包括端口监控、生物多样性调查、压载水测试、土壤测试等等。 |
| 基因组编辑 | CRISPR(定期聚集空间短回文重复)基因组编辑拥有巨大的农业潜力、食品科学、环境科学和广泛的其他应用程序。 | 证实基因淘汰赛,——而非目标效应分析,评估基因编辑的功能影响。 |
植物基因组测序加速作物研究
本研讨会讨论的影响高质量、可负担得起的新创在农作物研究基因组装配。艾瑟夫巴德Distelfeld从特拉维夫大学最近讨论了小麦基因组装配祖细胞生成,以及这种新资源如何帮助改善小麦育种。
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