Illumina DRAGEN生物it平台

Illumina Dragen(动态读取分析基因组学)Bio-IT平台提供了测序数据的准确,超快速的二次基因组分析。阅读更多...
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本地服务器

Illumina公司DRAGEN服务器V3

20040619

价格

DRAGEN服务器拉特1 1年许可

20060397

DRAGEN服务器2级1年许可证

20060398

Dragen Server LVL 3 1年许可证

20060399

Dragen Server LVL 4 1年许可证

20060400

DRAGEN服务器Lvl 5 1年许可证

20060401.


云计算:亚马逊网络服务

Dragen AWS LVL 1 1年许可证

20060402

DRAGEN AWS Lvl 2 1年许可证

20060403.

DRAGEN AWS拉特3 1年许可

20060404.

DRAGEN AWS Lvl 4 1年许可证

20060405.

Dragen AWS LVL 5 1年许可证

20060406.


云计算:微软Azure

DRAGEN天青拉特1 1年许可

20060407.

Dragen Azure LVL 2 1年许可证

20060408

Dragen Azure LVL 3 1年许可证

20060409.

Dragen Azure LVL 4 1年许可证

20060410

龙腾Azure 5级1年许可证

20060411.

产品亮点

Illumina Dragen Bio-IT平台提供:
  • 准确的数据:检测具有高分析敏感性和特异性的小变体1
  • 无损基因组压缩:减少FASTQ文件大小高达5倍用DRAGEN ORA(原读取归档)无损压缩
  • 强劲的速度:在大约25分钟内以30倍覆盖范围处理整个人类基因组2,3
  • 频繁的发布:包括定期增强和升级的版本
  • 各种应用:分析全基因组、外显子和RNA的下一代测序(NGS)数据

Basespace序列集线器上的Illumina Dragen Bio-IT平台和数据提交应用程序也支持SARS-COV-2数据工具包。亚博官网人口

DRAGEN祭

拖动Illumina连接的分析

在Basespace序列集线器上拖动

DRAGEN本地服务器



拖动netteSeq 1000/2000

Dragen Multi-Cloud带来自己的许可证

AWS Marketplace上的DRAGEN

超快速二级基因组分析

DRAGEN平台可以在大约25分钟内处理整个人类基因组的30×覆盖的NGS数据,而传统的基于cpu的系统则需要15小时。它创造了两个基因组数据分析的世界速度记录。2,3

有成本效益的解决方案

当Illumina的BaseSpace序列集线器或Illumina的关联分析运行,分析30倍基因组〜$ 5 /样品,并在100倍覆盖率〜$ 3 /样本的外显子组。

高度准确的结果

在2020年的PROFISIONFDA真理挑战V2中,DRADEN赢得了难以映射地区和illumina测序数据的所有基准区域。1

多样化的应用程序

DRADREN平台分析来自各种实验类型的测序数据,包括全基因组,整个外展,种系和体细胞数据集以及RNA测序实验。

无损压缩基因组

Dragen Ora(原始读取归档)压缩技术针对快速文件的高压缩比以及快速压缩和减压进行了优化,同时保留了数据完整性。

频繁的更新

频繁的发布不断拓展和完善DRAGEN平台,同时适应新的应用和解决不断发展的行业标准。DRAGEN更新版本控制,根据需要使用户能够选择加入或退出的新的更新。

DRAGEN胜PrecisionFDA真理挑战V2关键类别

Illumina DRAGEN团队激动地宣布在Illumina测序数据的难绘制区域和所有基准区域中获得最佳表现。这次胜利标志着主要新功能的开始,这些功能将得到改进,包括结构变体、拷贝数变体和重复扩展。我们的成功表明,我们现在可以更准确地调用变异,而不是在难以绘制的区域。

亚博官网人口

DRAGEN平台使各种规模和学科的实验室能够对他们的基因组数据做更多的工作。DRAGEN平台使用高度可重构现场可编程门阵列技术(FPGA),提供基因组分析算法的硬件加速实现,如BCL转换、映射、对齐、排序、重复标记和单倍型变体调用。DRAGEN ORA无损基因组压缩技术可以显著节省FASTQ文件的存储成本。DRAGEN平台的基本特性解决了基因组分析的共同挑战,如冗长的计算时间和大量的数据。

在不影响精度,DRAGEN平台提供速度,灵活性和成本效益。在DRAGEN平台的可重新编程特性使Illumina公司开发定制算法,并允许进行改进,以适应未来的应用。

关键拖动应用程序

DRAGEN本地服务器 BaseSpace Illumina公司联系分析 NextSeq 1000/2000 带自己的许可证
多路分解(BCL转换)
DRAGEN ORA无损压缩的基因组
地图和对齐
全基因组(种系和体细胞) 只有种系
外显子组富集(种系和体细胞)
covidseq.
RNA病原体检测
RNA-SEQ(基因融合&定量)
单细胞RNA
联合基因分型
甲基化
TSO 500液体
Metagenomics.
管道 描述 变异种检测到的 提供指标
DRAGEN多路分解 NGS分析的快速解复用 N / A. N / A.
DRAGEN压缩 同时保持数据的完整性DRAGEN ORA压缩为的FASTQ文件高压缩比,以及快速压缩和解压优化,所有。 N / A.
  • 压缩率
  • 运行时
DRAGEN地图+对齐 龙腾地图+对齐可以作为一个独立的或作为龙腾管道套件的一部分运行 N / A.
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
DRAGEN生殖系 Dragen系列管线提供端到端的NGS分析,包括提高准确性的先进的误差模型校准,并通过Illumina扩展猎人重复扩展检测和基因分型。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN体细胞 Dragen Somatic管道包括仅肿瘤和肿瘤正常模式,用于检测肿瘤样品中的体细胞体变体。两种模式都没有倍性假设,使得能够检测低频等位基因。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • TMB.
  • MSI
  • HLA.
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
拖着富集 Dragen Enrichment Pipeline将Dragen的种系和躯体呼叫者结合到专门用于分析富集样品的管道中。包括一套完整的丰富度量和报告。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN RNA DRAGEN RNA Pipeline执行转录组分析,从剪接连接发现和比对开始,然后是快速比对和剪接连接定位和定量。对于差分表达式,Illumina推荐使用BaseSpace Sequence Hub上的DRAGEN差分表达式应用程序。
  • 基因融合
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN单细胞RNA 所述DRAGEN单细胞RNA管道执行解复用,细胞 - 条形码和UMI纠错,序列比对,和基因表达的定量。 N / A.
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • Callability报告
  • 细胞指标
DRAGEN联合基因分型 该DRAGEN联合基因分型/人口管道调用在加快速度以不妥协的准确性共同变种在多个基因组,并扩展到样本的大同伙。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN甲基 DRAGEN甲基化管道执行对齐、甲基调用,并计算对齐和甲基化指标。 N / A.
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN参考生成器 接受FASTA文件,并构建DRADREN应用程序使用的专有引用。 N / A. N / A.
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA分析软件 Illumina Trusight肿瘤学500 CTDNA的二级分析支持。仅在本地Dragen Server(版本3)上可用
  • SNV
  • CNV
  • DNA融合
  • MSI
  • TMB.
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告

亚历山大比西纳诺,创始人和磷的首席执行官,该公司是如何使用的DRAGEN生物IT平台讨论进行基因组学数据分析现场,并在可访问的价格点。

阅读面试
SARS-COV-2 NGS数据工具包

Illumina通过一个免费的集成软件工具包,使研究人员更容易检测和识别SARS-CoV-2,并将他们的发现贡献给社区。

亚博官网人口
SARS-COV-2 NGS数据工具包

在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上的DRAGEN将DRAGEN平台的速度和准确性与我们的软件平台的安全性、成本节约和直观的界面结合起来。

  • 按按钮分析不同的专业水平
  • 直接从仪器快速分析流数据
  • 低成本,无需硬件投资
  • 利用Basespace序列集线器和亚马逊Web服务的安全性,合规性和存储功能(AWS)

yobet亚洲了解Basespace序列集线器

yobet亚洲了解Illumina公司关联分析

在Basespace序列集线器上拖动

与传统的基于cpu的系统相比,DRAGEN内部进行二次分析的时间更短,同时仍然保持较高的准确性。

  • 本地分析和存储数据
  • 支持不同级别的命令行接口
  • 取代多达30个传统的计算实例
  • 在<25分钟内以30倍的覆盖率处理整个人类基因组的NGS数据
  • 一个单元支持两个NovaSeq 6000系统满负荷运行

读数据表

DRAGEN内部

板载Dren Bio-IT平台提供超快速准确的次要分析解决方案。

  • 获取选择DRAGEN信息管道
  • 允许用户在短短两小时内生成结果
  • 为各种基因组分析解决方案提供优化的硬件加速算法,包括BCL转换、映射、比对、排序、重复标记和变体调用
  • 使用管道算法减少对外部信息学专家的依赖

读数据表

DRAGEN对AWS和Azure中为您提供您的首选云访问DRAGEN软件在虚拟图像。

  • 使用与DRAGEN本地服务器相同的软件和命令行选项(不包括TSO 500管道)
  • 适合希望将DRAGEN管道集成到现有云环境中的高级用户
DRAGEN内部
查看视频
龙根- gatk最佳实践网络研讨会:深入探讨基因组分析管道的改进

在这个网络研讨会上,广泛研究所的埃里克银行描述了在调查Dragen和Gatk工具之间的差异时遇到的一些问题,突出了新的最佳实践管道中实施的方法的改进。

您还将了解团队如何评估管yobet亚洲道的开源版本和许可(硬件加速)版本之间的功能等效性,显示相同源输入上两种方法之间的结果。

查看会议记录

GeneDx从外显子到基因组使用DRAGEN

利用DRADEN,ENEDX现在能够在保持成本低,转变时间短,高精度的同时发展其运营。

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雷迪儿童医院

吉尼斯世界纪录被设定为最快的遗传诊断19.5小时。所述DRAGEN平台被用来显著增加映射和对准的基因组数据的速度一次测序。1

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邢癌症治疗

看看Basespace Sequence Hub和DRAGEN是如何简化本实验室的NGS数据分析的。

观看视频

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人口测序

快速分析测序的基因组;随着时间的推移,加速重新分析作为计算工具。

NICU和遗传疾病研究

降低基因组分析,当快速的结果可能是一个关键因素所需的时间。

癌症研究

肿瘤只和肿瘤/正常样品的准确,快速分析。

Agrigenomics.

使用提供的参考分析不同基因组复杂性的动物和植物。

临床和翻译研究

通过快速转机和高精度分析有针对性的Exome数据,以确保再现性和高质量的结果。

参考
  1. PrecisionFDA真理挑战v2:在难以绘制地区的短期和长读取的呼叫变体。precision.fda.gov/challenges/10.2020年11月3日。
  2. 生物IT世界。费城儿童医院,EDICO为次要分析速度设定了世界纪录。2017年10月23日。www.bio-itworld.com/2017/10/23/childrens-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed.aspx.已于2018年9月19日生效。
  3. 圣地亚哥联盟论坛报。罗西儿童研究所设定了吉尼斯世界纪录。2018年2月12日。www.sandiegouniontribune.com/news/health/sd -不-拉迪-记录- 20180209 - story.html.已于2018年9月19日生效。

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