NextSeq 1000/2000试剂

NextSeq 1000/2000试剂包包含试剂盒,流池和再悬浮缓冲液。多个流单元配置提供可调输出基于项目需要。
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试剂

NextSeq 1000/2000 P1试剂(300循环)

20050264

价格

P2试剂(100循环)v3

20046811

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P2试剂(200循环)v3

20046812

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P2试剂(300循环)v3

20046813

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PhiX Control v3

fc - 110 - 3001

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NextSeq 1000/2000回收工具

20050631

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产品亮点

多流单元配置
  • 支持每次运行30-360 Gb的排序输出,根据项目需要提供可调输出
  • 增加了支持新的和正在出现的应用程序的灵活性
小型化设计便于储存、使用和处置
  • 尽量减少包装和浪费
  • 集成和可回收的流式细胞/试剂盒
设计显著降低了中通量测序的成本和复杂性
  • 提高产量,降低操作成本,提高易用性
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可以找到Illumina公共数据页面在这里

NextSeq 2000: Illumina外显子组- Illumina DNA富集(复制NA12878)
Illumina综合癌症组的AmpliSeq(复制NA12878)
NextSeq 2000: TruSeq链mRNA(复制UHR)

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规范

比较表

外显子组测序的等效性能
NextSeq 550系统 NextSeq 2000系统运行1 NextSeq 2000系统运行2
主要运行指标
配对端读取PF 514.2米 518.3米 532.8米
收益率 103.9 Gb 103.7 Gb 106.5 Gb
出错率 0.34% 0.32% 0.30%
二级分析指标
常染色体callability 95.61% 95.95% 95.94%
%对齐读取 99.15% 99.08% 99.07%
平均目标覆盖深度 78.05 77.85 78.15
覆盖的均匀性 93.20% 93.23% 93.28%
SNV精度 99.3% 99.3% 99.33%
SNV回忆 94.1% 94.2% 94.27%
Indel精度 88.0% 89.3% 89.19%
Indel回忆 83.3% 84.7% 84.75%
批量mRNA测序的等效性能
NextSeq 550系统 NextSeq 2000系统运行1 NextSeq 2000系统运行2
度规
配对端读取PF 422.4米 511.6米 523.7米
收益率 63.6 Gb 76.76 Gb 78.25 Gb
出错率 0.27% 0.27% 0.33%
意思是没有。检测到的基因(n = 24) 24355年 24284年 24357年

支持数据和数字

使用NextSeq 550系统的批量mRNA-Seq对特定RNA靶标的定量显示在y轴上。使用NextSeq 2000系统的结果绘制在x轴上。沿着y = x趋势线(R2> 0.99横跨四个重复)。

一致结果图
读取长度 NextSeq 1000/2000 P1试剂 NextSeq 1000/2000 P2试剂 NextSeq 2000 P3试剂
每个流单元的输出一个
1 × 50 bp(仅P3) 60 Gb
2 × 50 bp 40 Gb 120 Gb
2 × 100 bp 80 Gb 240 Gb
2 × 150bp 30 Gb 120 Gb 360 Gb
读论坛 100米 400米 1.2 b
质量分数b
1 × 50 bp ≥90%碱基高于Q30
2 × 50 bp ≥90%碱基高于Q30
2 × 100 bp ≥85%碱基高于Q30
2 × 150bp ≥85%碱基高于Q30
运行时
1 × 50 bp ~ 11个小时
2 × 50 bp ~ 13个小时 ~ 19小时
2 × 100 bp ~ 21小时 ~ 33小时
2 × 150bp ~ 19小时 ~ 29个小时 ~ 48小时
  1. 在支持的簇密度下,使用Illumina PhiX控制库基于单个流单元的输出规范。CPF =集群通过过滤器。
  2. 质量评分基于使用Illumina PhiX控制库。性能可能因库的类型和质量、插入尺寸、加载浓度和其他实验因素而不同

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