NextSeq 550系统 | NextSeq 2000系统运行1 | NextSeq 2000系统运行2 | |
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主要运行指标 | |||
配对端读取PF | 514.2米 | 518.3米 | 532.8米 |
收益率 | 103.9 Gb | 103.7 Gb | 106.5 Gb |
出错率 | 0.34% | 0.32% | 0.30% |
二级分析指标 | |||
常染色体callability | 95.61% | 95.95% | 95.94% |
%对齐读取 | 99.15% | 99.08% | 99.07% |
平均目标覆盖深度 | 78.05 | 77.85 | 78.15 |
覆盖的均匀性 | 93.20% | 93.23% | 93.28% |
SNV精度 | 99.3% | 99.3% | 99.33% |
SNV回忆 | 94.1% | 94.2% | 94.27% |
Indel精度 | 88.0% | 89.3% | 89.19% |
Indel回忆 | 83.3% | 84.7% | 84.75% |
NextSeq 550系统 | NextSeq 2000系统运行1 | NextSeq 2000系统运行2 | |
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度规 | |||
配对端读取PF | 422.4米 | 511.6米 | 523.7米 |
收益率 | 63.6 Gb | 76.76 Gb | 78.25 Gb |
出错率 | 0.27% | 0.27% | 0.33% |
意思是没有。检测到的基因(n = 24) | 24355年 | 24284年 | 24357年 |
读取长度 | NextSeq 1000/2000 P1试剂 | NextSeq 1000/2000 P2试剂 | NextSeq 2000 P3试剂 |
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每个流单元的输出一个 | |||
1 × 50 bp(仅P3) | 60 Gb | ||
2 × 50 bp | 40 Gb | 120 Gb | |
2 × 100 bp | 80 Gb | 240 Gb | |
2 × 150bp | 30 Gb | 120 Gb | 360 Gb |
读论坛 | 100米 | 400米 | 1.2 b |
质量分数b | |||
1 × 50 bp | ≥90%碱基高于Q30 | ||
2 × 50 bp | ≥90%碱基高于Q30 | ||
2 × 100 bp | ≥85%碱基高于Q30 | ||
2 × 150bp | ≥85%碱基高于Q30 | ||
运行时 | |||
1 × 50 bp | ~ 11个小时 | ||
2 × 50 bp | ~ 13个小时 | ~ 19小时 | |
2 × 100 bp | ~ 21小时 | ~ 33小时 | |
2 × 150bp | ~ 19小时 | ~ 29个小时 | ~ 48小时 |
技术说明| PDF |3版本
技术说明| PDF3 MB
应用说明| PDF< 1 MB
应用笔记| PDF3 MB
NextSeq™1000和NextSeq 2000测序系统规格表
数据表| PDF< 1 MB