在RNA测序(RNA- seq)之前耗尽核糖体RNA (rRNA)可以让研究人员专注于分析转录组的高价值部分。Illumina rRNA去除溶液为RNA-Seq库的制备设定了rRNA和珠蛋白mRNA的去除标准。
rRNA耗尽过程:
工具包 | 设备描述 | RNA样本类型 | 删除Euk。细胞质核糖体rna | 删除线粒体核糖体rna | 去除细菌核糖体rna | 去除叶绿体rRNA | 删除球蛋白mRNA | 取代停止设备 |
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Illumina绞合总RNA制备及核糖零加 | 快速的库准备从广泛的样本类型研究编码和非编码转录组无与伦比的研究灵活性。 | 人类和其他动物物种;FFPE RNA | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | 核糖零核糖核酸清除试剂盒(人/小鼠/大鼠) 核糖零金核糖核酸去除试剂盒(人/小鼠/大鼠) |
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人类/小鼠/大鼠流行病学(如病毒感染)和微生物组样本 |
✓ | ✓ | ✓ | ✓ | 核糖零金rRNA去除试剂盒(流行病学) | |||
细菌 (革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的混合种群) |
✓ | 零核糖核酸去除试剂盒(细菌) | ||||||
革兰氏阴性细菌(大肠杆菌) |
✓ | 核糖零核糖核酸清除试剂盒(革兰氏阴性菌) | ||||||
革兰氏阳性菌(枯草芽孢杆菌) | ✓ | rRNA去除试剂盒(革兰氏阳性菌) | ||||||
哺乳动物血液RNA | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | 珠蛋白零金试剂盒 | |||
TruSeq链总RNA与核糖零植物 | 利用此RNA-Seq文库准备工作流程获取植物转录组的全面视图。 | 植物叶组织 |
✓ | ✓ | ✓ | 核糖零核糖核酸去除试剂盒(植物叶片) | ||
植物种子或根组织 | ✓ | ✓ | ✓ | 核糖零核糖核酸去除试剂盒(植物种子/根) | ||||
定制的解决方案 | 目前没有可用的 | 酵母 | ✓ | ✓ | 零核糖核酸去除试剂盒(酵母) | |||
TruSeq链总RNA金 | 一种强大的、高度可扩展的全转录组分析(RNA-Seq)溶液,适用于各种物种和样本类型,包括人类、小鼠和福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织。 | 人类和其他动物物种和FFPE RNA | ✓ | ✓ | ||||
含核糖零珠蛋白的TruSeq链总RNA | 从血液来源的RNA中制备全转录组测序库,采用高效的工作流程,一步即可去除核糖体RNA和珠蛋白mRNA。 | 哺乳动物血液RNA | ✓ | ✓ | ✓ |