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鉴定序列变体并与疾病相关,必须确认协会及其生物效应。变型可以对蛋白质结构,基因表达和调节具有各种影响,或者它可能没有任何影响。基于阵列和排序的方法可以帮助研究人员确定变种如何影响疾病生物学。
常见的表达定量特质基因座(EQTL)是理解监管变异遗传架构的强大工具。
基因组区域的细微映射可以阐明SNP和疾病之间的联系。这可以通过目标重构或由个人研究人员或联盟设计的定制基因分型阵列来完成。这些方法使研究人员能够放大兴趣区域,避免基因组的无关区,并节省资源。
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通过表征变形的下游效应,研究人员可以更好地了解疾病的分子机制。基因组变体并不总是影响蛋白质结构或功能。实际上,许多序列变体调节基因表达。
RNA测序(RNA-Seq)为评估变异如何影响转录和蛋白质翻译提供了许多优势。RNA- seq是一种了解转录组的不偏不倚的方法,可以量化RNA活性,捕捉微妙的基因表达变化。
基因分型使研究人员能够探索诸如SNP和不平衡结构DNA的变体变化,并深入了解遗传变异的功能影响。
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