extSeq序列规范
extSeq550系统排序性能参数
| extSeq550系统高输出工具* | extSeq550系统中输出工具* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 读长 | 全时时间† | 输出 | 读长 | 全时时间† | 输出 |
| 2x150b | 29时 | 100-120Gb | 2x150b | 26时 | 5-39Gb |
| 2x75b | 18时 | 50-60Gb | 2x75b | 15时 | 16.25-19.5千兆 |
| 1x75b | 11时 | 25-30Gb | |||
ilumaphiX控制库支持集群密度(129至165k/m2集群传递滤波器)实际性能参数可能因样本类型、样本质量和集群传递滤波而异下Seq550包配端功能
总计时间包括集群生成、排序和基地调用NextSeq550系统
读传递滤镜
| extSeq550系统高输出工具 | extSeq550系统中输出工具 | |
|---|---|---|
| 单读 | 高达4亿 | 最高1.3亿 |
| 百分百读 | 高达8亿 | 最高2.6亿 |
质量评分††
| extSeq550系统高输出工具 | extSeq550系统中输出工具 |
|---|---|
| 大于75%基2x150b | 大于75%基2x150b |
| 大于Q3080x2x75b | 大于Q3080x2x75b |
| 大于Q3080%基数 |
a质量评分(Q-score)预测基调报错概率百分数 > Q30在整个运行中均值
估计样本传递密钥应用
| extSeq550系统高输出工具 | extSeq550系统中输出工具 |
|---|---|
| 1人全基因组 | 3exomes |
| 十二大区 | 12浓缩板 |
| 16转录机 | 96amplicon板 |
extSeq550系统阵列扫描参数
| 数组 | 扫描时逐数组 | 扫描时间/ 样本 |
|---|---|---|
| 无限MeticationEPIC BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| 无限CytoSNP-850KBeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| humanCytoSNP-12BeadChip | 40分钟 | 3.3分钟 |
| 人类无限数12BeadChip | 40分钟 | 3.3分钟 |
