甲基化测序的好处
胞嘧啶甲基化可以显著改变基因的时空表达和染色质重塑。利用下一代测序(NGS)的力量，全基因组分析和定向方法都可以为研究人员提供深入了解单个核苷酸水平上的甲基化模式。
甲基化测序的优势:
- 发现整个人类基因组中CpG、CHH和CHG区域的甲基化模式
- 通过全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)，一种全基因组方法，观察大多数物种基因组中几乎每个胞嘧啶的甲基化
- 用少量的DNA捕获完整的样本多样性
- 覆盖由ENCODE、FANTOM5和Epigenomics路线图联盟通过靶向甲基化测序确定的人类基因组中新兴感兴趣的区域
亚硫酸氢盐测序是如何工作的?
许多方法利用高质量和高灵敏度的NGS进行甲基化分析。大多数方法依靠亚硫酸氢盐转化DNA来检测未甲基化的胞嘧啶。在库制备过程中，亚硫酸氢盐转化将未甲基胞嘧啶转变为尿嘧啶。在测序数据中，通过PCR将转化后的碱基识别为胸腺嘧啶，并使用读计数来确定甲基化胞嘧啶的百分比。
亚硫酸氢盐转换测序可以通过靶向方法完成，如扩增甲基测序或目标富集，或全基因组亚硫酸氢盐测序。此外，其他化学试剂如OxBS和TAB-Seq可以与NGS一起用于羟甲基化(5-hMc)的鉴定和甲基化(5-mc)分析。
看到DNA甲基化分析的现场指南以便深入研究甲基化分析方法。
甲基化测序工作流程
全球90%以上的测序数据是由Illumina的NGS技术生成的
Illumina为甲基化测序提供了一个完全支持的工作流，从库准备到数据分析。
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特色的出版物
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中国生物技术学报199 38-46 2015
单细胞DNA甲基组测序和表观基因组细胞状态动力学的生物信息学推断。
Cell Rep 10 1386-97 2015
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Nat Biotechnol 33 769-74 2015
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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版