RNA-SEQ图书馆准备的进步正在彻底改变转录组的研究。
整个转录组
测量基因和转录本丰度;检测编码和非编码RNA的已知和新特征。靶向杂交去除丰富的rRNA，集中在转录组的高价值部分。
信使核糖核酸
量化基因表达，鉴定编码转录组中的已知和新的同种型，检测基因融合和测量特异性表达。
RNA浓缩
分析感兴趣的聚焦基因组中的基因表达。提供定量表达信息以及对小变体和基因融合的检测。
RNA扩增子
使用聚合酶链反应(PCR)扩增子超深测序，分析感兴趣的RNA序列，差异表达分析，等位基因特异性表达测量，基因融合验证。
为您的实验选择RNA套件
| 应用程序 | 产品 | 好处 |
|---|---|---|
| 总RNA序列 | Illumina链总RNA Prep |
|
| 信使rna序列 | Illumina Stranded MRNA准备 |
|
| 有针对性的RNA序列 | Illumina RNA浓缩Prep |
|
RNA图书馆准备在一目了然
| 应用程序 | 整个转录组 | 信使核糖核酸 | RNA浓缩 |
|---|---|---|---|
| 实践时间 | <3小时 | <3小时 | < 2小时 |
| 周转时间 | ~ 7小时 | 6.5小时 | <9小时 |
| 输入 | 1至1000 ng标准质量RNA;10 NG以获得最佳性能和FFPE样本 | 25 ~ 1000ng标准质量RNA | 10 ng标准质量RNA;用于低质量/降解/ FFPE的20 ng RNA |
| 自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| PCR协议 | 没有 | 没有 | 是的 |
| 图书馆需要定量? | 是的 | 是的 | 是的 |
| 包括碎片？ | 是的 | 是的 | 不需要 |
| 产品 | Illumina链总RNA Prep | Illumina Stranded MRNA准备 | Illumina RNA浓缩Prep |
所有三个套件都允许您通过使用384个独特的双索引在单个Novaseq S4流电池上加载384个样本来降低测序成本，以实现更高的吞吐量测序。
标签的好处
串珠转座子标记技术是一项创新技术，应用于我们的图书馆制备组合。通过同时将gDNA片段化并添加Illumina测序引物，单粒标记可以让你比以前更快地获得序列就绪库。在没有辅助试剂或设备的情况下使您的图书馆正常化。减少周转时间和复杂性。
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理解适配器结扎
我们在NGS库准备中使用的另一项关键技术是适配器连接，它长期以来以一致性、高质量的数据而闻名。文库的制备方法是将gDNA或cDNA样本片段化，并将特定的适配器连接到片段两端。这些适配器包含测序引物杂交位点的全部补充。这消除了额外PCR步骤的需要，使过程完全自动化。
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向专家咨询，你可以通过Illumina Library Prep获得最多信息
我们将浏览您的需求并提出建议。
RNA-SEQ库预备方法和用例
两个套件的故事
两个流行的RNA库预备套件之间的批判性比较揭示了对进行RNA测序研究的研究人员感兴趣的新信息。
RNA方法海报
一套全面的NGS方法分析：
- RNA转录
- RNA-蛋白质相互作用
- 低水平的RNA
- RNA的修改
- RNA结构
RNA的方法回顾
这篇文章集合描述了RNA测序的各种NGS方法，由科学文献汇编，包括正反两方面，发表摘要和参考文献。
RNA测序示例免疫肿瘤学研究的工作流程
图书馆准备
测序
分析
相关解决方案
索引
增加每次运行测序的样本数量，并使用唯一的双索引适配器优化高通量测序。
umi
独特的分子识别器(UMIs)提供错误校正和准确性，并可以减少假阳性变异调用，同时增加变异检测灵敏度。
自动化
我们的合作伙伴开发了跨越我们图书馆准备投资组合的高吞吐量自动化方法。
RNA测序
在没有预先知识的情况下，在单一检测中检测已知和新的特征，包括转录本亚型、基因融合和单核苷酸变异。