靶向甲基化测序(Methyl-Seq)在亚硫酸氢盐全基因组测序和甲基化阵列之间提供了一种平衡、经济的选择,可以支持筛选和生物标志物发现的研究目标。1TruSeq Methyl Capture EPIC Library Prep支持研究人员更深入地了解甲基化在基因调控中的作用。
综合甲基化位点含量:与目前市场上的其他甲基测序试剂盒相比,该试剂盒对新兴表观遗传区域的覆盖范围明显更高(参见支持数据部分)。覆盖的表观遗传区域)。
最大化发现能力,最小化成本:有效地查询差异甲基化碱基,以节省研究经费。
方便的套件配置:包括亚硫酸氢盐转化,文库准备,目标富集,纯化试剂在一个单一的套件,方便订购。
用户友好的数据分析:分析BaseSpace序列中心与甲基化应用程序为生物学家设计的序列数据。
仪器 | 建议样本数量 | 读取长度 |
---|---|---|
NextSeq 550系统 | 每次运行8个样本(高输出;基于40倍的平均覆盖率和>,90%的目标碱基在≥10倍时被覆盖。 | 2 × 100 bp(建议最大) |
NovaSeq 6000系统 | 每次运行的样品(双流式电池):S1: 48, S2: 48, S4: 96(受可用索引组合的限制;基于b> 5500万次阅读) | 2 × 100 bp(建议最大) |
HiSeq 2500系统 | 每次运行样本:快速运行:8-12,高输出v4: 64(基于40倍的平均覆盖率和>90%的目标碱基覆盖≥10倍) | 2 × 100 bp(建议最大) |
HiSeq 3000系统 | 每次运行48个样本(基于40倍的平均覆盖率,在≥10倍的覆盖率下,90%的目标碱基被覆盖) | 2 × 100 bp(建议最大) |
HiSeq 4000系统 | 每次运行96个样本(基于40倍的平均覆盖率,在≥10倍的覆盖率下,90%的目标碱基被覆盖) | 2 × 100 bp(建议最大) |
TruSeq甲基捕获EPIC库准备试剂盒 | Infinium MethylationEPIC试剂盒 | |
---|---|---|
内容规范 | 目标超过330万cpg。询问生物学上重要的甲基组靶标。 | 目标85万cpg。定量询问选择甲基化位点在整个基因组。 |
描述 | 对一组甲基组靶点进行集中分析,以寻求一种平衡的、具有成本效益的选择,可以支持筛选研究和生物标志物发现的研究目标。 | 对基因组中选定的甲基化位点进行定量分析,以每个样本的最低成本提供高通量研究能力。 |
输入数量 | 500ng人类基因组DNA | 250 ng DNA |
方法 | 甲基化测序,靶向DNA测序 | 甲基化数组 |
样本数量 | 最多12路 | 每个阵列8个样本 |
物种分类 | 人类 | 人类 |
技术 | 测序 | 微阵列 |
数据表| PDF2 MB