COVIDSeq测试(RUO版)

Illumina COVIDSeq Test (RUO版本)是一种基于扩增的NGS检测方法，包括2019-nCoV引物，旨在检测SARS-CoV-2病毒的突变和特征RNA，以帮助临床研究实验室识别和跟踪SARS-CoV-2新毒株的出现和流行。

快速，可扩展的SARS-COV-2检测

Illumina covid - seq测试(RUO版本)可按比例放大或缩小，以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上，分别使用两种SP或S4试剂，12小时内可处理1536 - 3072个结果;使用NextSeq 2000 P2 v3试剂或NextSeq 500/550/550Dx (Research Mode) HO试剂，12小时内可处理384个结果。

工作流和组件

工作流程包括病毒RNA提取，RNA至cDNA转化，PCR，文库制备，测序，分析和报告生成步骤。关键组件包括高通量Novaseq 6000系统或NextSeq 2000系统或NextSeq 500/550 / 550DX（在研究模式）系统，加上Illumina Covidseq测试（Ruo版）和Dragen Covidseq测试应用程序（Ruo版）在Basespace序列集线器中进行快速分析。

设计和质量控制

Illumina covid - seq检测(RUO版本)利用经验证的、可公开获得的ARTIC多重PCR方案的改进版本，结合已验证的Illumina测序技术，采用98个扩增子，用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列。当检测到+90个扩增子时，covid - seq提供一致序列信息。PCR步骤的63°C退火温度改进了变异分析——为了解样本中SARS-CoV-2毒株提供了重要的信息，并能够跟踪病毒毒株。

共识序列信息(FASTA文件)可以上传到开放的软件工具，以分配沿袭和注释突变。FASTA文件可以轻松上传到NCBI和/或GISAID应用程序直接通过BaseSpace测序Hub，以增加便利。