TruSight癌症
这些专家定义的测序研究面板靶向94个基因和与倾向于各种癌症的易感性相关的284个SNP。阅读更多…
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与癌症基因组学专家合作开发，这些预测的即用的寡核苷酸使研究人员能够序列以前与癌症倾向相关的各种基因和单核苷酸多态性（SNP）。
Trusight癌症包括与常见（例如，乳腺，结肠直肠）和罕见癌症相关的基因。此外，该组包括通过基因组 - 宽协会研究（GWAS）与癌症相关的284个SNP。内容选择是基于科学文献和其他高质量资源的专家策划。
Trusight癌症测序面板提供定制的寡核苷酸，其定位确定的兴趣区域。为四种富集反应提供足够的产品。Trusight癌症与之兼容TruSight快速捕获．
使用TruSight Cancer测序面板制备了6个人类参考样本。这些文库在MiniSeq系统上进行了测序，使用了高输出试剂盒，具有2 x 100 bp的读长配置和双索引。总收率为5.2 Gb，其中95.8%的碱基在Q30及以上。
*注意，访问该数据需要BaseSpace Sequence Hub登录。
该产品可用作Illumina Advantage（TG）产品．Illumina Advantage大规模测序产品具有特定的货物和测试，延长保质期和高级变更通知，实现更高的实验室效率。
| 仪器 | 建议样本数目 | 读取长度 |
|---|---|---|
| MiniSeq系统 | 每次运行的样本:中输出:12，高输出:24(基于每个目标> 20x覆盖率) | 最多2×150 bp |
| MiSeq系统 | 每次测试的样品(通过试剂试剂盒版本):v2: 12, v3: 24(基于每个目标的> 20x覆盖率) | 最多2×150 bp |
| NextSeq 550系统 | 每次运行的样本:中输出:96，高输出:96(基于每个目标> 20x覆盖率) | 最多2×150 bp |
| TruSight癌症 | AmpliSeq用于Illumina BRCA面板 | |
|---|---|---|
| 测定时间 | 1.5天 | 5小时(仅限图书馆预科;不包括库量化、规范化或池化时间) |
| 癌症类型 | Pan-Cancer | 固体肿瘤 |
| 内容规范 | 固定的探针，丰富94个基因和284个SNPs与常见和罕见癌症。 | 外显子区和侧翼内含子序列BRCA1和BRCA2 |
| 描述 | 常见和罕见癌症的种系突变检测研究。 | 种系和体细胞分析研究BRCA1和BRCA2． |
| 实践时间 | 5个小时 | < 1.5小时 |
| 输入数量 | 50 ng DNA | 1-100 ng(建议每个池10 ng) |
| 方法 | 目标浓缩目标浓缩,有针对性的DNA测序 | 扩增子测序，有针对性的DNA测序 |
| 多路复用 | 高达96-plex | 96双指标组合 |
| 专门的样本类型 | 不是FFPE-Compatible | 血,FFPE组织 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 |
| 变量类 | 生殖系变异 | 种系变异，插入-缺失(indels)，单核苷酸多态性(SNPs)，体细胞变异 |
MGZ医学遗传中心的研究人员正在使用Infinium CytoSNP-850K BeadChip和TruSight Cancer Panel来分析染色体异常。
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关于生物标志物专利和产品特定用途独特的专利说明：
一些基因组变体，包括一些核酸序列，以及它们在特定应用中的用途可以通过专利保护。建议客户确定是否需要从拥有或控制此类专利的方获得许可证，以便在客户的特定应用中使用该产品。
