TruSight骨髓测序面板使用expert-defined内容和证明下一代测序(上天)技术来识别体细胞变异在髓系恶性血液病。
面板的内容是由公认的专家组成的一个财团设计在血液癌症疾病经常和目标基因突变:
TruSight骨髓测序面板覆盖15个完整的基因(外显子)和39额外基因致癌热点覆盖,提供一个综合评价的关键基因被认为与髓系恶性血液病在单个测试。结果是准确的,具有成本效益的解决方案,使研究人员分析液体肿瘤。
TruSight骨髓库适合运行在桌面音序器和调用执行校准和变体MiSeq记者与体细胞变异或本地运行经理扩增子工作流调用者。过滤和注释就可以进行使用BaseSpace变体翻译。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| MiniSeq系统 | 样品每运行:中期输出:2 - 3,高输出:8(基于95%的扩增子在> 500 x覆盖率) | 2×150个基点(max推荐) |
| MiSeq系统 | 每运行v3 8样本试剂(基于95%的扩增子在> 500 x覆盖率) | 2×150个基点(max推荐) |
| NextSeq 550系统 | 样品每运行:中期输出:48,高输出:96(基于95%的扩增子在> 500 x覆盖率) | 2×150个基点(max推荐) |
| TruSight骨髓测序面板 | AmpliSeq Illumina公司骨髓面板 | AmpliSeq Illumina公司癌症热点面板v2 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | 8小时 | 5.5 - 7.5小时(图书馆准备;不包括图书馆量化、规范化或池时间) | 5个小时(图书馆准备;不包括图书馆量化、规范化或池时间) |
| 癌症类型 | 血液 | 血液 | Pan-Cancer,固体肿瘤 |
| 内容规范 | 目标54与髓系恶性肿瘤相关的基因。探测器放大568扩增子从肿瘤抑制基因和突变热点。 | 目标生物标志物在69个基因(40关键目标基因DNA, RNA 29日融合驱动基因,和5)基因表达水平 | 热点地区50基因已知与癌症有关联 |
| 描述 | 体细胞突变检测研究髓系恶性血液病。 | 目标面板研究40 DNA基因,29 RNA基因融合司机,5与骨髓癌症相关基因表达水平。 | 体细胞分析研究的热点地区50个癌症相关基因。 |
| 实践时间 | 3个小时 | < 1.5小时 | < 1.5小时 |
| 输入数量 | 50 ng | 20 ng高质量DNA;10 ng高质量RNA 每个池(10 ng推荐) |
1 - 100 ng (10 ng推荐/池) |
| 方法 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序 |
| 多路复用 | 96 -丛 | 96 -丛 | 96双指数组合 |
| 核酸类型 | DNA | DNA, RNA | DNA |
| 专门的样本类型 | 不是FFPE-Compatible | 血液、骨髓,而不是FFPE-Compatible | FFPE组织 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 | 人类 |
| ABL1 | CEBPA | 极品 | MYD88 | SF3B1 |
| ASXL1 | CSF3R | IDH1 | NOTCH1 | SMC1A |
| ATRX | CUX1 | IDH2 | NPM1 | SMC3 |
| BCOR | DNMT3A | IKZF1 | 国家管制当局方面 | SRSF2 |
| BCORL1 | ETV6 /电话 | JAK2 | PDGFRA | STAG2 |
| BRAF | EZH2 | JAK3 | PHF6 | TET2 |
| CALR | FBXW7 | KDM6A | PTEN | TP53 |
| CBL | FLT3 | 工具包 | PTPN11 | U2AF1 |
| CBLB | GATA1 | 喀斯特 | RAD21 | WT1 |
| CBLC | GATA2 | MLL | RUNX1 | ZRSR2 |
| CDKN2A | 玲娜 | MPL | SETBP1 |
